Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ncapd2Q8K2Z4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Ncapd2Q8K2Z4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ncapd2Q8K2Z4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
Ncapd2Q8K2Z4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ncapd2Q8K2Z4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ncapd2Q8K2Z4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ncapd2Q8K2Z4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ncapd2Q8K2Z4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ncapd2Q8K2Z4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ncapd2Q8K2Z4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ncapd2Q8K2Z4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ncapd2Q8K2Z4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ncapd2Q8K2Z4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ncapd2Q8K2Z4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ncapd2Q8K2Z4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ncapd2Q8K2Z4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ncapd2Q8K2Z4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ncapd2Q8K2Z4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ncapd2Q8K2Z4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ncapd2Q8K2Z4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ncapd2Q8K2Z4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ncapd2Q8K2Z4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ncapd2Q8K2Z4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ncapd2Q8K2Z4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Ncapd2Q8K2Z4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ncapd2Q8K2Z4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ncapd2Q8K2Z4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ncapd2Q8K2Z4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ncapd2Q8K2Z4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ncapd2Q8K2Z4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ncapd2Q8K2Z4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ncapd2Q8K2Z4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ncapd2Q8K2Z4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ncapd2Q8K2Z4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ncapd2Q8K2Z4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ncapd2Q8K2Z4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ncapd2Q8K2Z4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ncapd2Q8K2Z4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Ncapd2Q8K2Z4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ncapd2Q8K2Z4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Ncapd2Q8K2Z4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ncapd2Q8K2Z4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ncapd2Q8K2Z4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ncapd2Q8K2Z4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ncapd2Q8K2Z4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ncapd2Q8K2Z4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ncapd2Q8K2Z4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Ncapd2Q8K2Z4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ncapd2Q8K2Z4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Ncapd2Q8K2Z4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ncapd2Q8K2Z4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ncapd2Q8K2Z4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ncapd2Q8K2Z4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ncapd2Q8K2Z4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ncapd2Q8K2Z4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ncapd2Q8K2Z4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Ncapd2Q8K2Z4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ncapd2Q8K2Z4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ncapd2Q8K2Z4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ncapd2Q8K2Z4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ncapd2Q8K2Z4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ncapd2Q8K2Z4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ncapd2Q8K2Z4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ncapd2Q8K2Z4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ncapd2Q8K2Z4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Ncapd2Q8K2Z4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ncapd2Q8K2Z4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ncapd2Q8K2Z4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ncapd2Q8K2Z4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ncapd2Q8K2Z4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ncapd2Q8K2Z4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ncapd2Q8K2Z4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ncapd2Q8K2Z4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ncapd2Q8K2Z4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ncapd2Q8K2Z4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ncapd2Q8K2Z4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ncapd2Q8K2Z4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ncapd2Q8K2Z4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ncapd2Q8K2Z4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ncapd2Q8K2Z4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Ncapd2Q8K2Z4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ncapd2Q8K2Z4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ncapd2Q8K2Z4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ncapd2Q8K2Z4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ncapd2Q8K2Z4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ncapd2Q8K2Z4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ncapd2Q8K2Z4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ncapd2Q8K2Z4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ncapd2Q8K2Z4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ncapd2Q8K2Z4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ncapd2Q8K2Z4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ncapd2Q8K2Z4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ncapd2Q8K2Z4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ncapd2Q8K2Z4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ncapd2Q8K2Z4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ncapd2Q8K2Z4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms