Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Depp1Q8K2F3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Depp1Q8K2F3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Depp1Q8K2F3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Depp1Q8K2F3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Depp1Q8K2F3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Depp1Q8K2F3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Depp1Q8K2F3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Depp1Q8K2F3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Depp1Q8K2F3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Depp1Q8K2F3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Depp1Q8K2F3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Depp1Q8K2F3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Depp1Q8K2F3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Depp1Q8K2F3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Depp1Q8K2F3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Depp1Q8K2F3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Depp1Q8K2F3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Depp1Q8K2F3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Depp1Q8K2F3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Depp1Q8K2F3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Depp1Q8K2F3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Depp1Q8K2F3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Depp1Q8K2F3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Depp1Q8K2F3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Depp1Q8K2F3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Depp1Q8K2F3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Depp1Q8K2F3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Depp1Q8K2F3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Depp1Q8K2F3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Depp1Q8K2F3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Depp1Q8K2F3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Depp1Q8K2F3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Depp1Q8K2F3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Depp1Q8K2F3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Depp1Q8K2F3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Depp1Q8K2F3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Depp1Q8K2F3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Depp1Q8K2F3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Depp1Q8K2F3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Depp1Q8K2F3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Depp1Q8K2F3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Depp1Q8K2F3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Depp1Q8K2F3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Depp1Q8K2F3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Depp1Q8K2F3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Depp1Q8K2F3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Depp1Q8K2F3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Depp1Q8K2F3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Depp1Q8K2F3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Depp1Q8K2F3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Depp1Q8K2F3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Depp1Q8K2F3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Depp1Q8K2F3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Depp1Q8K2F3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Depp1Q8K2F3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Depp1Q8K2F3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Depp1Q8K2F3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Depp1Q8K2F3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Depp1Q8K2F3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Depp1Q8K2F3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Depp1Q8K2F3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Depp1Q8K2F3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Depp1Q8K2F3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Depp1Q8K2F3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Depp1Q8K2F3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Depp1Q8K2F3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Depp1Q8K2F3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Depp1Q8K2F3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Depp1Q8K2F3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Depp1Q8K2F3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Depp1Q8K2F3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Depp1Q8K2F3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Depp1Q8K2F3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Depp1Q8K2F3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Depp1Q8K2F3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Depp1Q8K2F3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Depp1Q8K2F3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Depp1Q8K2F3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Depp1Q8K2F3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Depp1Q8K2F3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Depp1Q8K2F3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Depp1Q8K2F3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Depp1Q8K2F3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Depp1Q8K2F3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Depp1Q8K2F3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Depp1Q8K2F3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Depp1Q8K2F3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Depp1Q8K2F3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Depp1Q8K2F3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Depp1Q8K2F3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Depp1Q8K2F3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Depp1Q8K2F3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Depp1Q8K2F3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Depp1Q8K2F3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Depp1Q8K2F3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Depp1Q8K2F3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Depp1Q8K2F3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Depp1Q8K2F3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Depp1Q8K2F3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms