Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2C9

Hacd3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd3Q8K2C9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hacd3Q8K2C9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hacd3Q8K2C9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hacd3Q8K2C9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hacd3Q8K2C9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hacd3Q8K2C9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hacd3Q8K2C9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hacd3Q8K2C9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hacd3Q8K2C9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hacd3Q8K2C9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hacd3Q8K2C9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hacd3Q8K2C9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hacd3Q8K2C9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hacd3Q8K2C9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hacd3Q8K2C9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hacd3Q8K2C9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hacd3Q8K2C9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hacd3Q8K2C9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hacd3Q8K2C9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hacd3Q8K2C9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Hacd3Q8K2C9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hacd3Q8K2C9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hacd3Q8K2C9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hacd3Q8K2C9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hacd3Q8K2C9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hacd3Q8K2C9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Hacd3Q8K2C9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hacd3Q8K2C9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hacd3Q8K2C9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hacd3Q8K2C9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hacd3Q8K2C9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hacd3Q8K2C9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hacd3Q8K2C9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hacd3Q8K2C9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hacd3Q8K2C9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hacd3Q8K2C9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hacd3Q8K2C9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hacd3Q8K2C9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Hacd3Q8K2C9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hacd3Q8K2C9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hacd3Q8K2C9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hacd3Q8K2C9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hacd3Q8K2C9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hacd3Q8K2C9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hacd3Q8K2C9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hacd3Q8K2C9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Hacd3Q8K2C9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hacd3Q8K2C9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hacd3Q8K2C9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hacd3Q8K2C9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hacd3Q8K2C9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hacd3Q8K2C9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hacd3Q8K2C9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hacd3Q8K2C9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hacd3Q8K2C9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hacd3Q8K2C9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hacd3Q8K2C9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hacd3Q8K2C9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hacd3Q8K2C9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hacd3Q8K2C9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hacd3Q8K2C9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hacd3Q8K2C9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hacd3Q8K2C9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hacd3Q8K2C9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hacd3Q8K2C9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hacd3Q8K2C9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hacd3Q8K2C9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hacd3Q8K2C9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hacd3Q8K2C9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hacd3Q8K2C9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hacd3Q8K2C9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hacd3Q8K2C9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hacd3Q8K2C9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hacd3Q8K2C9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Hacd3Q8K2C9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Hacd3Q8K2C9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hacd3Q8K2C9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hacd3Q8K2C9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Hacd3Q8K2C9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hacd3Q8K2C9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hacd3Q8K2C9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hacd3Q8K2C9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hacd3Q8K2C9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hacd3Q8K2C9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hacd3Q8K2C9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hacd3Q8K2C9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hacd3Q8K2C9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hacd3Q8K2C9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hacd3Q8K2C9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hacd3Q8K2C9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hacd3Q8K2C9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hacd3Q8K2C9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hacd3Q8K2C9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hacd3Q8K2C9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hacd3Q8K2C9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hacd3Q8K2C9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hacd3Q8K2C9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hacd3Q8K2C9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hacd3Q8K2C9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hacd3Q8K2C9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms