Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mtmr3Q8K296 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Mtmr3Q8K296 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mtmr3Q8K296 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mtmr3Q8K296 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Mtmr3Q8K296 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mtmr3Q8K296 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mtmr3Q8K296 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mtmr3Q8K296 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mtmr3Q8K296 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mtmr3Q8K296 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mtmr3Q8K296 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mtmr3Q8K296 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mtmr3Q8K296 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mtmr3Q8K296 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mtmr3Q8K296 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Mtmr3Q8K296 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mtmr3Q8K296 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mtmr3Q8K296 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mtmr3Q8K296 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mtmr3Q8K296 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mtmr3Q8K296 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mtmr3Q8K296 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mtmr3Q8K296 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mtmr3Q8K296 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mtmr3Q8K296 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mtmr3Q8K296 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mtmr3Q8K296 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mtmr3Q8K296 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mtmr3Q8K296 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mtmr3Q8K296 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mtmr3Q8K296 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mtmr3Q8K296 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mtmr3Q8K296 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mtmr3Q8K296 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Mtmr3Q8K296 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mtmr3Q8K296 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mtmr3Q8K296 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Mtmr3Q8K296 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mtmr3Q8K296 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mtmr3Q8K296 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mtmr3Q8K296 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mtmr3Q8K296 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mtmr3Q8K296 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mtmr3Q8K296 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mtmr3Q8K296 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mtmr3Q8K296 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mtmr3Q8K296 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mtmr3Q8K296 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mtmr3Q8K296 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mtmr3Q8K296 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mtmr3Q8K296 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Mtmr3Q8K296 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mtmr3Q8K296 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mtmr3Q8K296 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mtmr3Q8K296 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mtmr3Q8K296 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mtmr3Q8K296 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mtmr3Q8K296 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mtmr3Q8K296 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mtmr3Q8K296 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mtmr3Q8K296 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mtmr3Q8K296 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mtmr3Q8K296 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mtmr3Q8K296 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mtmr3Q8K296 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mtmr3Q8K296 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mtmr3Q8K296 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Mtmr3Q8K296 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mtmr3Q8K296 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mtmr3Q8K296 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mtmr3Q8K296 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mtmr3Q8K296 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mtmr3Q8K296 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mtmr3Q8K296 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mtmr3Q8K296 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mtmr3Q8K296 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mtmr3Q8K296 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mtmr3Q8K296 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mtmr3Q8K296 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mtmr3Q8K296 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mtmr3Q8K296 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mtmr3Q8K296 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mtmr3Q8K296 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mtmr3Q8K296 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mtmr3Q8K296 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mtmr3Q8K296 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mtmr3Q8K296 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mtmr3Q8K296 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mtmr3Q8K296 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mtmr3Q8K296 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mtmr3Q8K296 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mtmr3Q8K296 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mtmr3Q8K296 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mtmr3Q8K296 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mtmr3Q8K296 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Mtmr3Q8K296 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mtmr3Q8K296 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mtmr3Q8K296 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mtmr3Q8K296 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms