Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1S6

Spire2, Protein spire homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire2Q8K1S6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Spire2Q8K1S6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Spire2Q8K1S6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Spire2Q8K1S6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Spire2Q8K1S6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Spire2Q8K1S6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Spire2Q8K1S6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Spire2Q8K1S6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Spire2Q8K1S6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Spire2Q8K1S6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Spire2Q8K1S6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Spire2Q8K1S6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Spire2Q8K1S6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Spire2Q8K1S6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Spire2Q8K1S6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Spire2Q8K1S6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Spire2Q8K1S6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Spire2Q8K1S6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Spire2Q8K1S6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Spire2Q8K1S6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Spire2Q8K1S6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Spire2Q8K1S6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Spire2Q8K1S6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Spire2Q8K1S6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Spire2Q8K1S6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Spire2Q8K1S6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Spire2Q8K1S6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Spire2Q8K1S6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Spire2Q8K1S6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Spire2Q8K1S6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Spire2Q8K1S6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Spire2Q8K1S6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Spire2Q8K1S6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Spire2Q8K1S6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Spire2Q8K1S6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Spire2Q8K1S6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Spire2Q8K1S6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Spire2Q8K1S6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Spire2Q8K1S6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Spire2Q8K1S6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Spire2Q8K1S6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Spire2Q8K1S6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Spire2Q8K1S6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Spire2Q8K1S6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Spire2Q8K1S6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Spire2Q8K1S6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Spire2Q8K1S6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Spire2Q8K1S6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Spire2Q8K1S6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Spire2Q8K1S6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Spire2Q8K1S6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Spire2Q8K1S6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Spire2Q8K1S6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Spire2Q8K1S6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Spire2Q8K1S6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Spire2Q8K1S6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Spire2Q8K1S6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Spire2Q8K1S6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Spire2Q8K1S6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Spire2Q8K1S6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Spire2Q8K1S6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Spire2Q8K1S6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Spire2Q8K1S6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Spire2Q8K1S6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Spire2Q8K1S6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Spire2Q8K1S6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Spire2Q8K1S6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Spire2Q8K1S6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Spire2Q8K1S6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Spire2Q8K1S6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Spire2Q8K1S6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Spire2Q8K1S6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Spire2Q8K1S6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Spire2Q8K1S6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Spire2Q8K1S6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Spire2Q8K1S6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Spire2Q8K1S6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Spire2Q8K1S6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Spire2Q8K1S6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Spire2Q8K1S6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Spire2Q8K1S6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Spire2Q8K1S6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Spire2Q8K1S6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Spire2Q8K1S6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Spire2Q8K1S6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Spire2Q8K1S6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Spire2Q8K1S6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Spire2Q8K1S6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Spire2Q8K1S6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Spire2Q8K1S6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Spire2Q8K1S6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Spire2Q8K1S6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Spire2Q8K1S6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Spire2Q8K1S6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Spire2Q8K1S6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Spire2Q8K1S6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Spire2Q8K1S6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Spire2Q8K1S6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Spire2Q8K1S6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Spire2Q8K1S6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms