Protein–RNA interactions for Protein: Q8HWB2

H2-Q4, Histocompatibility 2, Q region locus 4, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q4Q8HWB2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
H2-Q4Q8HWB2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
H2-Q4Q8HWB2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
H2-Q4Q8HWB2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H2-Q4Q8HWB2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H2-Q4Q8HWB2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
H2-Q4Q8HWB2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
H2-Q4Q8HWB2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
H2-Q4Q8HWB2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
H2-Q4Q8HWB2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
H2-Q4Q8HWB2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
H2-Q4Q8HWB2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
H2-Q4Q8HWB2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H2-Q4Q8HWB2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
H2-Q4Q8HWB2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H2-Q4Q8HWB2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
H2-Q4Q8HWB2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
H2-Q4Q8HWB2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H2-Q4Q8HWB2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
H2-Q4Q8HWB2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
H2-Q4Q8HWB2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
H2-Q4Q8HWB2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
H2-Q4Q8HWB2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
H2-Q4Q8HWB2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
H2-Q4Q8HWB2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H2-Q4Q8HWB2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
H2-Q4Q8HWB2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H2-Q4Q8HWB2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H2-Q4Q8HWB2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H2-Q4Q8HWB2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H2-Q4Q8HWB2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H2-Q4Q8HWB2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H2-Q4Q8HWB2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
H2-Q4Q8HWB2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H2-Q4Q8HWB2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
H2-Q4Q8HWB2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
H2-Q4Q8HWB2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H2-Q4Q8HWB2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H2-Q4Q8HWB2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H2-Q4Q8HWB2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
H2-Q4Q8HWB2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H2-Q4Q8HWB2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H2-Q4Q8HWB2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H2-Q4Q8HWB2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H2-Q4Q8HWB2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
H2-Q4Q8HWB2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H2-Q4Q8HWB2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
H2-Q4Q8HWB2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
H2-Q4Q8HWB2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2-Q4Q8HWB2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2-Q4Q8HWB2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2-Q4Q8HWB2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
H2-Q4Q8HWB2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H2-Q4Q8HWB2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H2-Q4Q8HWB2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
H2-Q4Q8HWB2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H2-Q4Q8HWB2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H2-Q4Q8HWB2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H2-Q4Q8HWB2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
H2-Q4Q8HWB2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H2-Q4Q8HWB2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H2-Q4Q8HWB2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
H2-Q4Q8HWB2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
H2-Q4Q8HWB2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
H2-Q4Q8HWB2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
H2-Q4Q8HWB2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
H2-Q4Q8HWB2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
H2-Q4Q8HWB2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
H2-Q4Q8HWB2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
H2-Q4Q8HWB2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H2-Q4Q8HWB2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H2-Q4Q8HWB2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H2-Q4Q8HWB2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H2-Q4Q8HWB2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H2-Q4Q8HWB2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H2-Q4Q8HWB2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H2-Q4Q8HWB2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H2-Q4Q8HWB2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H2-Q4Q8HWB2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H2-Q4Q8HWB2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
H2-Q4Q8HWB2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H2-Q4Q8HWB2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H2-Q4Q8HWB2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H2-Q4Q8HWB2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H2-Q4Q8HWB2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
H2-Q4Q8HWB2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H2-Q4Q8HWB2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H2-Q4Q8HWB2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
H2-Q4Q8HWB2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
H2-Q4Q8HWB2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H2-Q4Q8HWB2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
H2-Q4Q8HWB2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
H2-Q4Q8HWB2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
H2-Q4Q8HWB2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
H2-Q4Q8HWB2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
H2-Q4Q8HWB2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
H2-Q4Q8HWB2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
H2-Q4Q8HWB2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
H2-Q4Q8HWB2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H2-Q4Q8HWB2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms