Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf628Q8CJ78 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf628Q8CJ78 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf628Q8CJ78 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf628Q8CJ78 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf628Q8CJ78 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Znf628Q8CJ78 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf628Q8CJ78 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf628Q8CJ78 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf628Q8CJ78 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf628Q8CJ78 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf628Q8CJ78 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf628Q8CJ78 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Znf628Q8CJ78 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf628Q8CJ78 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf628Q8CJ78 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf628Q8CJ78 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf628Q8CJ78 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf628Q8CJ78 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf628Q8CJ78 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf628Q8CJ78 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf628Q8CJ78 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf628Q8CJ78 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf628Q8CJ78 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Znf628Q8CJ78 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Znf628Q8CJ78 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Znf628Q8CJ78 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Znf628Q8CJ78 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Znf628Q8CJ78 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Znf628Q8CJ78 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf628Q8CJ78 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf628Q8CJ78 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf628Q8CJ78 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf628Q8CJ78 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf628Q8CJ78 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Znf628Q8CJ78 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf628Q8CJ78 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf628Q8CJ78 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf628Q8CJ78 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Znf628Q8CJ78 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf628Q8CJ78 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf628Q8CJ78 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf628Q8CJ78 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf628Q8CJ78 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf628Q8CJ78 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf628Q8CJ78 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Znf628Q8CJ78 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf628Q8CJ78 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf628Q8CJ78 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf628Q8CJ78 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znf628Q8CJ78 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf628Q8CJ78 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf628Q8CJ78 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf628Q8CJ78 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf628Q8CJ78 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf628Q8CJ78 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf628Q8CJ78 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf628Q8CJ78 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf628Q8CJ78 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znf628Q8CJ78 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf628Q8CJ78 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf628Q8CJ78 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf628Q8CJ78 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf628Q8CJ78 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf628Q8CJ78 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf628Q8CJ78 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Znf628Q8CJ78 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Znf628Q8CJ78 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Znf628Q8CJ78 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf628Q8CJ78 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf628Q8CJ78 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf628Q8CJ78 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf628Q8CJ78 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Znf628Q8CJ78 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znf628Q8CJ78 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf628Q8CJ78 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf628Q8CJ78 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf628Q8CJ78 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Znf628Q8CJ78 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf628Q8CJ78 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf628Q8CJ78 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf628Q8CJ78 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf628Q8CJ78 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf628Q8CJ78 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf628Q8CJ78 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Znf628Q8CJ78 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf628Q8CJ78 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Znf628Q8CJ78 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf628Q8CJ78 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf628Q8CJ78 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf628Q8CJ78 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf628Q8CJ78 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Znf628Q8CJ78 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Znf628Q8CJ78 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf628Q8CJ78 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf628Q8CJ78 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Znf628Q8CJ78 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Znf628Q8CJ78 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Znf628Q8CJ78 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf628Q8CJ78 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms