Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TwnkQ8CIW5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TwnkQ8CIW5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TwnkQ8CIW5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TwnkQ8CIW5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TwnkQ8CIW5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TwnkQ8CIW5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TwnkQ8CIW5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TwnkQ8CIW5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TwnkQ8CIW5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TwnkQ8CIW5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TwnkQ8CIW5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TwnkQ8CIW5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TwnkQ8CIW5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TwnkQ8CIW5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TwnkQ8CIW5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TwnkQ8CIW5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TwnkQ8CIW5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TwnkQ8CIW5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TwnkQ8CIW5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TwnkQ8CIW5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TwnkQ8CIW5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TwnkQ8CIW5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TwnkQ8CIW5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TwnkQ8CIW5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TwnkQ8CIW5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TwnkQ8CIW5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TwnkQ8CIW5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TwnkQ8CIW5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TwnkQ8CIW5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TwnkQ8CIW5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TwnkQ8CIW5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TwnkQ8CIW5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TwnkQ8CIW5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TwnkQ8CIW5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TwnkQ8CIW5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TwnkQ8CIW5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TwnkQ8CIW5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TwnkQ8CIW5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TwnkQ8CIW5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TwnkQ8CIW5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TwnkQ8CIW5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TwnkQ8CIW5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TwnkQ8CIW5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TwnkQ8CIW5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TwnkQ8CIW5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TwnkQ8CIW5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TwnkQ8CIW5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TwnkQ8CIW5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TwnkQ8CIW5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TwnkQ8CIW5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TwnkQ8CIW5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TwnkQ8CIW5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TwnkQ8CIW5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TwnkQ8CIW5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TwnkQ8CIW5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TwnkQ8CIW5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TwnkQ8CIW5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TwnkQ8CIW5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TwnkQ8CIW5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TwnkQ8CIW5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TwnkQ8CIW5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TwnkQ8CIW5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TwnkQ8CIW5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TwnkQ8CIW5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TwnkQ8CIW5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TwnkQ8CIW5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TwnkQ8CIW5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TwnkQ8CIW5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TwnkQ8CIW5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TwnkQ8CIW5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TwnkQ8CIW5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TwnkQ8CIW5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TwnkQ8CIW5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TwnkQ8CIW5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TwnkQ8CIW5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TwnkQ8CIW5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TwnkQ8CIW5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TwnkQ8CIW5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TwnkQ8CIW5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TwnkQ8CIW5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TwnkQ8CIW5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TwnkQ8CIW5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TwnkQ8CIW5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TwnkQ8CIW5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TwnkQ8CIW5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TwnkQ8CIW5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TwnkQ8CIW5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TwnkQ8CIW5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TwnkQ8CIW5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TwnkQ8CIW5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TwnkQ8CIW5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TwnkQ8CIW5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TwnkQ8CIW5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TwnkQ8CIW5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TwnkQ8CIW5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TwnkQ8CIW5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TwnkQ8CIW5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TwnkQ8CIW5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TwnkQ8CIW5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms