Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI43

Myl6b, Myosin light chain 6B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myl6bQ8CI43 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Myl6bQ8CI43 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myl6bQ8CI43 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myl6bQ8CI43 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myl6bQ8CI43 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myl6bQ8CI43 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Myl6bQ8CI43 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myl6bQ8CI43 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myl6bQ8CI43 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myl6bQ8CI43 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Myl6bQ8CI43 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Myl6bQ8CI43 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Myl6bQ8CI43 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Myl6bQ8CI43 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myl6bQ8CI43 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myl6bQ8CI43 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myl6bQ8CI43 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myl6bQ8CI43 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myl6bQ8CI43 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myl6bQ8CI43 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Myl6bQ8CI43 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Myl6bQ8CI43 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Myl6bQ8CI43 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Myl6bQ8CI43 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Myl6bQ8CI43 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Myl6bQ8CI43 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myl6bQ8CI43 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myl6bQ8CI43 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myl6bQ8CI43 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myl6bQ8CI43 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myl6bQ8CI43 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myl6bQ8CI43 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Myl6bQ8CI43 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Myl6bQ8CI43 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myl6bQ8CI43 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myl6bQ8CI43 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myl6bQ8CI43 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myl6bQ8CI43 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myl6bQ8CI43 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myl6bQ8CI43 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myl6bQ8CI43 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Myl6bQ8CI43 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myl6bQ8CI43 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Myl6bQ8CI43 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Myl6bQ8CI43 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Myl6bQ8CI43 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Myl6bQ8CI43 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Myl6bQ8CI43 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myl6bQ8CI43 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myl6bQ8CI43 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myl6bQ8CI43 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myl6bQ8CI43 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myl6bQ8CI43 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Myl6bQ8CI43 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Myl6bQ8CI43 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Myl6bQ8CI43 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Myl6bQ8CI43 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Myl6bQ8CI43 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Myl6bQ8CI43 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Myl6bQ8CI43 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Myl6bQ8CI43 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Myl6bQ8CI43 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myl6bQ8CI43 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Myl6bQ8CI43 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myl6bQ8CI43 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myl6bQ8CI43 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myl6bQ8CI43 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myl6bQ8CI43 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myl6bQ8CI43 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myl6bQ8CI43 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myl6bQ8CI43 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myl6bQ8CI43 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myl6bQ8CI43 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myl6bQ8CI43 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myl6bQ8CI43 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myl6bQ8CI43 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myl6bQ8CI43 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Myl6bQ8CI43 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Myl6bQ8CI43 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Myl6bQ8CI43 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myl6bQ8CI43 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myl6bQ8CI43 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myl6bQ8CI43 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Myl6bQ8CI43 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myl6bQ8CI43 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myl6bQ8CI43 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myl6bQ8CI43 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myl6bQ8CI43 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myl6bQ8CI43 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myl6bQ8CI43 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myl6bQ8CI43 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myl6bQ8CI43 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myl6bQ8CI43 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myl6bQ8CI43 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myl6bQ8CI43 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myl6bQ8CI43 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myl6bQ8CI43 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myl6bQ8CI43 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myl6bQ8CI43 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myl6bQ8CI43 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms