Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHT0

Aldh4a1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh4a1Q8CHT0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Aldh4a1Q8CHT0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Aldh4a1Q8CHT0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Aldh4a1Q8CHT0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Aldh4a1Q8CHT0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Aldh4a1Q8CHT0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Aldh4a1Q8CHT0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Aldh4a1Q8CHT0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Aldh4a1Q8CHT0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Aldh4a1Q8CHT0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Aldh4a1Q8CHT0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Aldh4a1Q8CHT0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Aldh4a1Q8CHT0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Aldh4a1Q8CHT0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Aldh4a1Q8CHT0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Aldh4a1Q8CHT0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Aldh4a1Q8CHT0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Aldh4a1Q8CHT0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Aldh4a1Q8CHT0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Aldh4a1Q8CHT0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Aldh4a1Q8CHT0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Aldh4a1Q8CHT0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Aldh4a1Q8CHT0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Aldh4a1Q8CHT0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Aldh4a1Q8CHT0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Aldh4a1Q8CHT0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Aldh4a1Q8CHT0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Aldh4a1Q8CHT0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Aldh4a1Q8CHT0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Aldh4a1Q8CHT0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Aldh4a1Q8CHT0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Aldh4a1Q8CHT0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Aldh4a1Q8CHT0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Aldh4a1Q8CHT0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Aldh4a1Q8CHT0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Aldh4a1Q8CHT0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Aldh4a1Q8CHT0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Aldh4a1Q8CHT0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Aldh4a1Q8CHT0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Aldh4a1Q8CHT0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Aldh4a1Q8CHT0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Aldh4a1Q8CHT0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Aldh4a1Q8CHT0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Aldh4a1Q8CHT0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Aldh4a1Q8CHT0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Aldh4a1Q8CHT0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Aldh4a1Q8CHT0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Aldh4a1Q8CHT0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Aldh4a1Q8CHT0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Aldh4a1Q8CHT0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Aldh4a1Q8CHT0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Aldh4a1Q8CHT0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Aldh4a1Q8CHT0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Aldh4a1Q8CHT0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Aldh4a1Q8CHT0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Aldh4a1Q8CHT0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Aldh4a1Q8CHT0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Aldh4a1Q8CHT0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Aldh4a1Q8CHT0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Aldh4a1Q8CHT0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Aldh4a1Q8CHT0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Aldh4a1Q8CHT0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Aldh4a1Q8CHT0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Aldh4a1Q8CHT0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Aldh4a1Q8CHT0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Aldh4a1Q8CHT0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Aldh4a1Q8CHT0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Aldh4a1Q8CHT0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Aldh4a1Q8CHT0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Aldh4a1Q8CHT0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Aldh4a1Q8CHT0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Aldh4a1Q8CHT0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Aldh4a1Q8CHT0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Aldh4a1Q8CHT0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Aldh4a1Q8CHT0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Aldh4a1Q8CHT0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Aldh4a1Q8CHT0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Aldh4a1Q8CHT0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Aldh4a1Q8CHT0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Aldh4a1Q8CHT0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Aldh4a1Q8CHT0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Aldh4a1Q8CHT0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Aldh4a1Q8CHT0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Aldh4a1Q8CHT0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Aldh4a1Q8CHT0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Aldh4a1Q8CHT0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Aldh4a1Q8CHT0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aldh4a1Q8CHT0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aldh4a1Q8CHT0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aldh4a1Q8CHT0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aldh4a1Q8CHT0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aldh4a1Q8CHT0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Aldh4a1Q8CHT0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aldh4a1Q8CHT0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aldh4a1Q8CHT0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aldh4a1Q8CHT0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aldh4a1Q8CHT0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aldh4a1Q8CHT0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aldh4a1Q8CHT0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Aldh4a1Q8CHT0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms