Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGV9

Tshz3, Teashirt homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,081 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tshz3Q8CGV9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tshz3Q8CGV9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tshz3Q8CGV9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tshz3Q8CGV9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tshz3Q8CGV9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tshz3Q8CGV9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Tshz3Q8CGV9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tshz3Q8CGV9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tshz3Q8CGV9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tshz3Q8CGV9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tshz3Q8CGV9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tshz3Q8CGV9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tshz3Q8CGV9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tshz3Q8CGV9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tshz3Q8CGV9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tshz3Q8CGV9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tshz3Q8CGV9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tshz3Q8CGV9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tshz3Q8CGV9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tshz3Q8CGV9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tshz3Q8CGV9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tshz3Q8CGV9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tshz3Q8CGV9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tshz3Q8CGV9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tshz3Q8CGV9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tshz3Q8CGV9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tshz3Q8CGV9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tshz3Q8CGV9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tshz3Q8CGV9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tshz3Q8CGV9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tshz3Q8CGV9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tshz3Q8CGV9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tshz3Q8CGV9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tshz3Q8CGV9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tshz3Q8CGV9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tshz3Q8CGV9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tshz3Q8CGV9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Tshz3Q8CGV9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tshz3Q8CGV9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tshz3Q8CGV9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tshz3Q8CGV9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tshz3Q8CGV9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tshz3Q8CGV9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Tshz3Q8CGV9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Tshz3Q8CGV9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tshz3Q8CGV9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tshz3Q8CGV9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tshz3Q8CGV9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tshz3Q8CGV9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tshz3Q8CGV9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tshz3Q8CGV9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tshz3Q8CGV9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tshz3Q8CGV9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tshz3Q8CGV9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tshz3Q8CGV9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Tshz3Q8CGV9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tshz3Q8CGV9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tshz3Q8CGV9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tshz3Q8CGV9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tshz3Q8CGV9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tshz3Q8CGV9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tshz3Q8CGV9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tshz3Q8CGV9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tshz3Q8CGV9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tshz3Q8CGV9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tshz3Q8CGV9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tshz3Q8CGV9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tshz3Q8CGV9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tshz3Q8CGV9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tshz3Q8CGV9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tshz3Q8CGV9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tshz3Q8CGV9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tshz3Q8CGV9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tshz3Q8CGV9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tshz3Q8CGV9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tshz3Q8CGV9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Tshz3Q8CGV9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tshz3Q8CGV9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tshz3Q8CGV9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tshz3Q8CGV9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Tshz3Q8CGV9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Tshz3Q8CGV9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Tshz3Q8CGV9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Tshz3Q8CGV9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tshz3Q8CGV9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tshz3Q8CGV9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tshz3Q8CGV9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tshz3Q8CGV9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tshz3Q8CGV9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Tshz3Q8CGV9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tshz3Q8CGV9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tshz3Q8CGV9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tshz3Q8CGV9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tshz3Q8CGV9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tshz3Q8CGV9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tshz3Q8CGV9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tshz3Q8CGV9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tshz3Q8CGV9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tshz3Q8CGV9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tshz3Q8CGV9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms