Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Setd1bQ8CFT2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Setd1bQ8CFT2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Setd1bQ8CFT2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Setd1bQ8CFT2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Setd1bQ8CFT2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Setd1bQ8CFT2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Setd1bQ8CFT2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Setd1bQ8CFT2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Setd1bQ8CFT2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Setd1bQ8CFT2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Setd1bQ8CFT2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Setd1bQ8CFT2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Setd1bQ8CFT2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Setd1bQ8CFT2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Setd1bQ8CFT2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Setd1bQ8CFT2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Setd1bQ8CFT2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Setd1bQ8CFT2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Setd1bQ8CFT2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Setd1bQ8CFT2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Setd1bQ8CFT2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Setd1bQ8CFT2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Setd1bQ8CFT2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Setd1bQ8CFT2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Setd1bQ8CFT2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
Setd1bQ8CFT2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Setd1bQ8CFT2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Setd1bQ8CFT2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Setd1bQ8CFT2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Setd1bQ8CFT2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Setd1bQ8CFT2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
Setd1bQ8CFT2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Setd1bQ8CFT2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
Setd1bQ8CFT2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Setd1bQ8CFT2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Setd1bQ8CFT2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Setd1bQ8CFT2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
Setd1bQ8CFT2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Setd1bQ8CFT2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Setd1bQ8CFT2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Setd1bQ8CFT2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Setd1bQ8CFT2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Setd1bQ8CFT2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Setd1bQ8CFT2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Setd1bQ8CFT2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Setd1bQ8CFT2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Setd1bQ8CFT2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Setd1bQ8CFT2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Setd1bQ8CFT2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Setd1bQ8CFT2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Setd1bQ8CFT2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
Setd1bQ8CFT2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Setd1bQ8CFT2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Setd1bQ8CFT2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Setd1bQ8CFT2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Setd1bQ8CFT2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Setd1bQ8CFT2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Setd1bQ8CFT2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Setd1bQ8CFT2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Setd1bQ8CFT2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Setd1bQ8CFT2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Setd1bQ8CFT2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Setd1bQ8CFT2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Setd1bQ8CFT2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Setd1bQ8CFT2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Setd1bQ8CFT2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Setd1bQ8CFT2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Setd1bQ8CFT2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Setd1bQ8CFT2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Setd1bQ8CFT2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Setd1bQ8CFT2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Setd1bQ8CFT2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Setd1bQ8CFT2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Setd1bQ8CFT2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Setd1bQ8CFT2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.14
Setd1bQ8CFT2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.14
Setd1bQ8CFT2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Setd1bQ8CFT2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Setd1bQ8CFT2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Setd1bQ8CFT2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Setd1bQ8CFT2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Setd1bQ8CFT2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Setd1bQ8CFT2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Setd1bQ8CFT2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Setd1bQ8CFT2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Setd1bQ8CFT2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
Setd1bQ8CFT2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Setd1bQ8CFT2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Setd1bQ8CFT2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Setd1bQ8CFT2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Setd1bQ8CFT2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Setd1bQ8CFT2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Setd1bQ8CFT2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Setd1bQ8CFT2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Setd1bQ8CFT2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Setd1bQ8CFT2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Setd1bQ8CFT2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Setd1bQ8CFT2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Setd1bQ8CFT2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms