Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Brf1Q8CFK2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Brf1Q8CFK2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Brf1Q8CFK2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Brf1Q8CFK2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Brf1Q8CFK2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Brf1Q8CFK2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Brf1Q8CFK2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Brf1Q8CFK2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Brf1Q8CFK2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Brf1Q8CFK2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Brf1Q8CFK2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Brf1Q8CFK2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Brf1Q8CFK2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Brf1Q8CFK2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Brf1Q8CFK2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Brf1Q8CFK2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Brf1Q8CFK2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Brf1Q8CFK2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Brf1Q8CFK2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Brf1Q8CFK2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Brf1Q8CFK2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Brf1Q8CFK2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Brf1Q8CFK2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Brf1Q8CFK2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Brf1Q8CFK2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Brf1Q8CFK2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Brf1Q8CFK2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Brf1Q8CFK2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Brf1Q8CFK2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Brf1Q8CFK2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Brf1Q8CFK2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Brf1Q8CFK2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Brf1Q8CFK2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Brf1Q8CFK2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Brf1Q8CFK2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Brf1Q8CFK2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Brf1Q8CFK2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Brf1Q8CFK2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Brf1Q8CFK2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Brf1Q8CFK2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Brf1Q8CFK2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Brf1Q8CFK2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Brf1Q8CFK2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Brf1Q8CFK2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Brf1Q8CFK2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Brf1Q8CFK2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Brf1Q8CFK2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Brf1Q8CFK2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Brf1Q8CFK2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Brf1Q8CFK2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Brf1Q8CFK2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Brf1Q8CFK2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Brf1Q8CFK2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Brf1Q8CFK2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Brf1Q8CFK2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Brf1Q8CFK2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Brf1Q8CFK2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Brf1Q8CFK2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Brf1Q8CFK2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Brf1Q8CFK2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Brf1Q8CFK2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Brf1Q8CFK2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Brf1Q8CFK2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Brf1Q8CFK2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Brf1Q8CFK2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Brf1Q8CFK2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Brf1Q8CFK2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Brf1Q8CFK2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Brf1Q8CFK2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Brf1Q8CFK2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Brf1Q8CFK2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Brf1Q8CFK2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Brf1Q8CFK2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Brf1Q8CFK2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Brf1Q8CFK2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Brf1Q8CFK2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Brf1Q8CFK2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Brf1Q8CFK2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Brf1Q8CFK2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Brf1Q8CFK2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Brf1Q8CFK2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Brf1Q8CFK2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Brf1Q8CFK2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Brf1Q8CFK2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Brf1Q8CFK2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Brf1Q8CFK2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Brf1Q8CFK2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Brf1Q8CFK2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Brf1Q8CFK2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Brf1Q8CFK2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Brf1Q8CFK2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Brf1Q8CFK2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Brf1Q8CFK2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Brf1Q8CFK2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Brf1Q8CFK2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Brf1Q8CFK2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Brf1Q8CFK2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Brf1Q8CFK2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Brf1Q8CFK2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
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