Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc178Q8CDV0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc178Q8CDV0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc178Q8CDV0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc178Q8CDV0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc178Q8CDV0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc178Q8CDV0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc178Q8CDV0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc178Q8CDV0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc178Q8CDV0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc178Q8CDV0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc178Q8CDV0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc178Q8CDV0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc178Q8CDV0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc178Q8CDV0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc178Q8CDV0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc178Q8CDV0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc178Q8CDV0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc178Q8CDV0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc178Q8CDV0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc178Q8CDV0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc178Q8CDV0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc178Q8CDV0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc178Q8CDV0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc178Q8CDV0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc178Q8CDV0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc178Q8CDV0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc178Q8CDV0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc178Q8CDV0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc178Q8CDV0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc178Q8CDV0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc178Q8CDV0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc178Q8CDV0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc178Q8CDV0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc178Q8CDV0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc178Q8CDV0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc178Q8CDV0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc178Q8CDV0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc178Q8CDV0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc178Q8CDV0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc178Q8CDV0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc178Q8CDV0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc178Q8CDV0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc178Q8CDV0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc178Q8CDV0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc178Q8CDV0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc178Q8CDV0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc178Q8CDV0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc178Q8CDV0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc178Q8CDV0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc178Q8CDV0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc178Q8CDV0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc178Q8CDV0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc178Q8CDV0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc178Q8CDV0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc178Q8CDV0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc178Q8CDV0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc178Q8CDV0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc178Q8CDV0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc178Q8CDV0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc178Q8CDV0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc178Q8CDV0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc178Q8CDV0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc178Q8CDV0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc178Q8CDV0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc178Q8CDV0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc178Q8CDV0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc178Q8CDV0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc178Q8CDV0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc178Q8CDV0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc178Q8CDV0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc178Q8CDV0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc178Q8CDV0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc178Q8CDV0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc178Q8CDV0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc178Q8CDV0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc178Q8CDV0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc178Q8CDV0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc178Q8CDV0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc178Q8CDV0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc178Q8CDV0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc178Q8CDV0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc178Q8CDV0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc178Q8CDV0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc178Q8CDV0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc178Q8CDV0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc178Q8CDV0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc178Q8CDV0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc178Q8CDV0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc178Q8CDV0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc178Q8CDV0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc178Q8CDV0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc178Q8CDV0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc178Q8CDV0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc178Q8CDV0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc178Q8CDV0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc178Q8CDV0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc178Q8CDV0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc178Q8CDV0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc178Q8CDV0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms