Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RybpQ8CCI5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RybpQ8CCI5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RybpQ8CCI5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RybpQ8CCI5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RybpQ8CCI5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RybpQ8CCI5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RybpQ8CCI5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RybpQ8CCI5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RybpQ8CCI5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RybpQ8CCI5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RybpQ8CCI5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RybpQ8CCI5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RybpQ8CCI5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RybpQ8CCI5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RybpQ8CCI5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RybpQ8CCI5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RybpQ8CCI5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RybpQ8CCI5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RybpQ8CCI5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RybpQ8CCI5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RybpQ8CCI5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RybpQ8CCI5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RybpQ8CCI5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RybpQ8CCI5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RybpQ8CCI5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RybpQ8CCI5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RybpQ8CCI5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RybpQ8CCI5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RybpQ8CCI5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RybpQ8CCI5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RybpQ8CCI5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RybpQ8CCI5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RybpQ8CCI5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RybpQ8CCI5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RybpQ8CCI5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RybpQ8CCI5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RybpQ8CCI5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RybpQ8CCI5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RybpQ8CCI5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RybpQ8CCI5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RybpQ8CCI5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RybpQ8CCI5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RybpQ8CCI5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RybpQ8CCI5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RybpQ8CCI5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RybpQ8CCI5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RybpQ8CCI5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RybpQ8CCI5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RybpQ8CCI5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RybpQ8CCI5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RybpQ8CCI5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RybpQ8CCI5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RybpQ8CCI5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RybpQ8CCI5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RybpQ8CCI5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RybpQ8CCI5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RybpQ8CCI5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RybpQ8CCI5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RybpQ8CCI5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RybpQ8CCI5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RybpQ8CCI5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RybpQ8CCI5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RybpQ8CCI5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RybpQ8CCI5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RybpQ8CCI5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RybpQ8CCI5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RybpQ8CCI5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RybpQ8CCI5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RybpQ8CCI5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RybpQ8CCI5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RybpQ8CCI5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RybpQ8CCI5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RybpQ8CCI5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RybpQ8CCI5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RybpQ8CCI5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RybpQ8CCI5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RybpQ8CCI5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RybpQ8CCI5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RybpQ8CCI5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RybpQ8CCI5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RybpQ8CCI5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RybpQ8CCI5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RybpQ8CCI5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RybpQ8CCI5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RybpQ8CCI5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RybpQ8CCI5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RybpQ8CCI5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RybpQ8CCI5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RybpQ8CCI5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RybpQ8CCI5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RybpQ8CCI5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RybpQ8CCI5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RybpQ8CCI5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RybpQ8CCI5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RybpQ8CCI5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RybpQ8CCI5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RybpQ8CCI5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RybpQ8CCI5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RybpQ8CCI5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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