Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCF0

Prpf31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf31Q8CCF0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prpf31Q8CCF0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prpf31Q8CCF0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prpf31Q8CCF0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prpf31Q8CCF0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prpf31Q8CCF0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prpf31Q8CCF0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prpf31Q8CCF0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prpf31Q8CCF0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prpf31Q8CCF0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prpf31Q8CCF0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Prpf31Q8CCF0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Prpf31Q8CCF0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prpf31Q8CCF0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prpf31Q8CCF0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prpf31Q8CCF0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prpf31Q8CCF0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prpf31Q8CCF0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prpf31Q8CCF0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prpf31Q8CCF0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prpf31Q8CCF0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prpf31Q8CCF0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prpf31Q8CCF0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prpf31Q8CCF0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prpf31Q8CCF0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prpf31Q8CCF0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prpf31Q8CCF0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prpf31Q8CCF0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prpf31Q8CCF0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prpf31Q8CCF0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prpf31Q8CCF0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prpf31Q8CCF0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prpf31Q8CCF0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prpf31Q8CCF0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prpf31Q8CCF0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prpf31Q8CCF0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prpf31Q8CCF0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prpf31Q8CCF0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prpf31Q8CCF0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Prpf31Q8CCF0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Prpf31Q8CCF0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prpf31Q8CCF0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prpf31Q8CCF0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prpf31Q8CCF0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prpf31Q8CCF0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prpf31Q8CCF0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prpf31Q8CCF0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prpf31Q8CCF0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prpf31Q8CCF0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Prpf31Q8CCF0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prpf31Q8CCF0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prpf31Q8CCF0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Prpf31Q8CCF0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Prpf31Q8CCF0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prpf31Q8CCF0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prpf31Q8CCF0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prpf31Q8CCF0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prpf31Q8CCF0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prpf31Q8CCF0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prpf31Q8CCF0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prpf31Q8CCF0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prpf31Q8CCF0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prpf31Q8CCF0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prpf31Q8CCF0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prpf31Q8CCF0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prpf31Q8CCF0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prpf31Q8CCF0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prpf31Q8CCF0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prpf31Q8CCF0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prpf31Q8CCF0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prpf31Q8CCF0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prpf31Q8CCF0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpf31Q8CCF0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpf31Q8CCF0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpf31Q8CCF0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpf31Q8CCF0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpf31Q8CCF0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpf31Q8CCF0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prpf31Q8CCF0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prpf31Q8CCF0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prpf31Q8CCF0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Prpf31Q8CCF0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Prpf31Q8CCF0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prpf31Q8CCF0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prpf31Q8CCF0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prpf31Q8CCF0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prpf31Q8CCF0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prpf31Q8CCF0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prpf31Q8CCF0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prpf31Q8CCF0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Prpf31Q8CCF0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prpf31Q8CCF0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prpf31Q8CCF0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prpf31Q8CCF0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prpf31Q8CCF0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prpf31Q8CCF0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prpf31Q8CCF0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prpf31Q8CCF0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prpf31Q8CCF0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prpf31Q8CCF0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms