Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCB4

Vps53, Vacuolar protein sorting-associated protein 53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps53Q8CCB4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vps53Q8CCB4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vps53Q8CCB4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps53Q8CCB4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps53Q8CCB4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps53Q8CCB4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps53Q8CCB4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps53Q8CCB4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps53Q8CCB4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps53Q8CCB4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps53Q8CCB4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps53Q8CCB4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps53Q8CCB4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps53Q8CCB4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps53Q8CCB4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps53Q8CCB4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps53Q8CCB4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps53Q8CCB4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps53Q8CCB4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps53Q8CCB4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps53Q8CCB4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Vps53Q8CCB4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vps53Q8CCB4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vps53Q8CCB4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vps53Q8CCB4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vps53Q8CCB4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vps53Q8CCB4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vps53Q8CCB4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vps53Q8CCB4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vps53Q8CCB4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps53Q8CCB4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps53Q8CCB4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps53Q8CCB4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps53Q8CCB4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps53Q8CCB4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps53Q8CCB4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps53Q8CCB4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps53Q8CCB4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps53Q8CCB4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps53Q8CCB4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps53Q8CCB4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps53Q8CCB4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps53Q8CCB4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps53Q8CCB4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps53Q8CCB4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps53Q8CCB4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps53Q8CCB4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps53Q8CCB4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps53Q8CCB4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps53Q8CCB4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps53Q8CCB4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps53Q8CCB4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps53Q8CCB4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps53Q8CCB4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps53Q8CCB4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vps53Q8CCB4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vps53Q8CCB4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vps53Q8CCB4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vps53Q8CCB4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vps53Q8CCB4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps53Q8CCB4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps53Q8CCB4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps53Q8CCB4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps53Q8CCB4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps53Q8CCB4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps53Q8CCB4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps53Q8CCB4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps53Q8CCB4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps53Q8CCB4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps53Q8CCB4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps53Q8CCB4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps53Q8CCB4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps53Q8CCB4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps53Q8CCB4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps53Q8CCB4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vps53Q8CCB4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vps53Q8CCB4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vps53Q8CCB4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vps53Q8CCB4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps53Q8CCB4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps53Q8CCB4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps53Q8CCB4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps53Q8CCB4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Vps53Q8CCB4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vps53Q8CCB4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vps53Q8CCB4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vps53Q8CCB4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vps53Q8CCB4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vps53Q8CCB4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps53Q8CCB4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps53Q8CCB4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps53Q8CCB4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps53Q8CCB4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps53Q8CCB4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps53Q8CCB4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vps53Q8CCB4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vps53Q8CCB4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vps53Q8CCB4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vps53Q8CCB4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vps53Q8CCB4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms