Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lrrn3Q8CBC6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lrrn3Q8CBC6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lrrn3Q8CBC6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lrrn3Q8CBC6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lrrn3Q8CBC6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lrrn3Q8CBC6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lrrn3Q8CBC6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lrrn3Q8CBC6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lrrn3Q8CBC6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lrrn3Q8CBC6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Lrrn3Q8CBC6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lrrn3Q8CBC6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lrrn3Q8CBC6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lrrn3Q8CBC6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lrrn3Q8CBC6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lrrn3Q8CBC6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lrrn3Q8CBC6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrrn3Q8CBC6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrrn3Q8CBC6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrrn3Q8CBC6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrrn3Q8CBC6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrrn3Q8CBC6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrrn3Q8CBC6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrrn3Q8CBC6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrrn3Q8CBC6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrrn3Q8CBC6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrrn3Q8CBC6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrrn3Q8CBC6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrrn3Q8CBC6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrrn3Q8CBC6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrrn3Q8CBC6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrrn3Q8CBC6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrrn3Q8CBC6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrrn3Q8CBC6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrrn3Q8CBC6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrrn3Q8CBC6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrrn3Q8CBC6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrrn3Q8CBC6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrrn3Q8CBC6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrrn3Q8CBC6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrrn3Q8CBC6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrrn3Q8CBC6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrrn3Q8CBC6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrrn3Q8CBC6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrrn3Q8CBC6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrrn3Q8CBC6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrrn3Q8CBC6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrrn3Q8CBC6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrrn3Q8CBC6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Lrrn3Q8CBC6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Lrrn3Q8CBC6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrrn3Q8CBC6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrrn3Q8CBC6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrrn3Q8CBC6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrrn3Q8CBC6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrrn3Q8CBC6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrrn3Q8CBC6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrrn3Q8CBC6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrrn3Q8CBC6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrrn3Q8CBC6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrrn3Q8CBC6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrrn3Q8CBC6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrrn3Q8CBC6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrrn3Q8CBC6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrrn3Q8CBC6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrrn3Q8CBC6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrrn3Q8CBC6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrrn3Q8CBC6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrrn3Q8CBC6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrrn3Q8CBC6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lrrn3Q8CBC6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrn3Q8CBC6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrn3Q8CBC6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrn3Q8CBC6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lrrn3Q8CBC6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrn3Q8CBC6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrn3Q8CBC6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrn3Q8CBC6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrn3Q8CBC6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Lrrn3Q8CBC6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrn3Q8CBC6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrn3Q8CBC6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrn3Q8CBC6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrn3Q8CBC6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrn3Q8CBC6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lrrn3Q8CBC6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrn3Q8CBC6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrn3Q8CBC6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrn3Q8CBC6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrn3Q8CBC6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrn3Q8CBC6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrn3Q8CBC6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrn3Q8CBC6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrn3Q8CBC6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lrrn3Q8CBC6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lrrn3Q8CBC6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lrrn3Q8CBC6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrn3Q8CBC6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrrn3Q8CBC6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms