Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atg4aQ8C9S8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atg4aQ8C9S8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atg4aQ8C9S8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atg4aQ8C9S8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Atg4aQ8C9S8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Atg4aQ8C9S8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Atg4aQ8C9S8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Atg4aQ8C9S8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atg4aQ8C9S8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atg4aQ8C9S8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atg4aQ8C9S8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atg4aQ8C9S8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atg4aQ8C9S8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atg4aQ8C9S8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atg4aQ8C9S8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atg4aQ8C9S8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atg4aQ8C9S8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atg4aQ8C9S8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atg4aQ8C9S8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atg4aQ8C9S8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atg4aQ8C9S8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atg4aQ8C9S8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atg4aQ8C9S8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atg4aQ8C9S8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atg4aQ8C9S8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atg4aQ8C9S8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atg4aQ8C9S8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atg4aQ8C9S8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atg4aQ8C9S8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atg4aQ8C9S8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atg4aQ8C9S8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atg4aQ8C9S8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atg4aQ8C9S8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atg4aQ8C9S8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atg4aQ8C9S8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atg4aQ8C9S8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atg4aQ8C9S8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atg4aQ8C9S8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atg4aQ8C9S8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atg4aQ8C9S8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atg4aQ8C9S8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atg4aQ8C9S8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atg4aQ8C9S8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atg4aQ8C9S8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atg4aQ8C9S8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atg4aQ8C9S8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atg4aQ8C9S8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atg4aQ8C9S8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atg4aQ8C9S8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atg4aQ8C9S8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atg4aQ8C9S8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atg4aQ8C9S8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atg4aQ8C9S8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Atg4aQ8C9S8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atg4aQ8C9S8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atg4aQ8C9S8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atg4aQ8C9S8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atg4aQ8C9S8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atg4aQ8C9S8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atg4aQ8C9S8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atg4aQ8C9S8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atg4aQ8C9S8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atg4aQ8C9S8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atg4aQ8C9S8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atg4aQ8C9S8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atg4aQ8C9S8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atg4aQ8C9S8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atg4aQ8C9S8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atg4aQ8C9S8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atg4aQ8C9S8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atg4aQ8C9S8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atg4aQ8C9S8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atg4aQ8C9S8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atg4aQ8C9S8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atg4aQ8C9S8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atg4aQ8C9S8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atg4aQ8C9S8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atg4aQ8C9S8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atg4aQ8C9S8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atg4aQ8C9S8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Atg4aQ8C9S8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atg4aQ8C9S8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atg4aQ8C9S8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atg4aQ8C9S8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atg4aQ8C9S8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atg4aQ8C9S8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atg4aQ8C9S8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atg4aQ8C9S8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atg4aQ8C9S8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atg4aQ8C9S8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atg4aQ8C9S8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atg4aQ8C9S8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atg4aQ8C9S8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atg4aQ8C9S8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atg4aQ8C9S8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atg4aQ8C9S8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atg4aQ8C9S8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atg4aQ8C9S8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Atg4aQ8C9S8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms