Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7U1

N4bp3, NEDD4-binding protein 3, mousemouse

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Length 537 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4bp3Q8C7U1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
N4bp3Q8C7U1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
N4bp3Q8C7U1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
N4bp3Q8C7U1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
N4bp3Q8C7U1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
N4bp3Q8C7U1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
N4bp3Q8C7U1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
N4bp3Q8C7U1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
N4bp3Q8C7U1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
N4bp3Q8C7U1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
N4bp3Q8C7U1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
N4bp3Q8C7U1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
N4bp3Q8C7U1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
N4bp3Q8C7U1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
N4bp3Q8C7U1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
N4bp3Q8C7U1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
N4bp3Q8C7U1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
N4bp3Q8C7U1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
N4bp3Q8C7U1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
N4bp3Q8C7U1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
N4bp3Q8C7U1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
N4bp3Q8C7U1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
N4bp3Q8C7U1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
N4bp3Q8C7U1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
N4bp3Q8C7U1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
N4bp3Q8C7U1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
N4bp3Q8C7U1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
N4bp3Q8C7U1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
N4bp3Q8C7U1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
N4bp3Q8C7U1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
N4bp3Q8C7U1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
N4bp3Q8C7U1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
N4bp3Q8C7U1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
N4bp3Q8C7U1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
N4bp3Q8C7U1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
N4bp3Q8C7U1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
N4bp3Q8C7U1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
N4bp3Q8C7U1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
N4bp3Q8C7U1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
N4bp3Q8C7U1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
N4bp3Q8C7U1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
N4bp3Q8C7U1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
N4bp3Q8C7U1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
N4bp3Q8C7U1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
N4bp3Q8C7U1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
N4bp3Q8C7U1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
N4bp3Q8C7U1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
N4bp3Q8C7U1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
N4bp3Q8C7U1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
N4bp3Q8C7U1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
N4bp3Q8C7U1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
N4bp3Q8C7U1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
N4bp3Q8C7U1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
N4bp3Q8C7U1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
N4bp3Q8C7U1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
N4bp3Q8C7U1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
N4bp3Q8C7U1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
N4bp3Q8C7U1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
N4bp3Q8C7U1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
N4bp3Q8C7U1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
N4bp3Q8C7U1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
N4bp3Q8C7U1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
N4bp3Q8C7U1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
N4bp3Q8C7U1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
N4bp3Q8C7U1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
N4bp3Q8C7U1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
N4bp3Q8C7U1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
N4bp3Q8C7U1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
N4bp3Q8C7U1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
N4bp3Q8C7U1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
N4bp3Q8C7U1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
N4bp3Q8C7U1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
N4bp3Q8C7U1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
N4bp3Q8C7U1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
N4bp3Q8C7U1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
N4bp3Q8C7U1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
N4bp3Q8C7U1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
N4bp3Q8C7U1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
N4bp3Q8C7U1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
N4bp3Q8C7U1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
N4bp3Q8C7U1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
N4bp3Q8C7U1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
N4bp3Q8C7U1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
N4bp3Q8C7U1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
N4bp3Q8C7U1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
N4bp3Q8C7U1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
N4bp3Q8C7U1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
N4bp3Q8C7U1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
N4bp3Q8C7U1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
N4bp3Q8C7U1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
N4bp3Q8C7U1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
N4bp3Q8C7U1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
N4bp3Q8C7U1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
N4bp3Q8C7U1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
N4bp3Q8C7U1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
N4bp3Q8C7U1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
N4bp3Q8C7U1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
N4bp3Q8C7U1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
N4bp3Q8C7U1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
N4bp3Q8C7U1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
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