Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0R0

Usp37, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 37, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp37Q8C0R0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp37Q8C0R0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp37Q8C0R0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp37Q8C0R0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp37Q8C0R0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp37Q8C0R0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp37Q8C0R0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp37Q8C0R0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp37Q8C0R0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp37Q8C0R0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp37Q8C0R0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp37Q8C0R0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp37Q8C0R0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp37Q8C0R0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp37Q8C0R0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp37Q8C0R0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp37Q8C0R0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Usp37Q8C0R0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Usp37Q8C0R0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp37Q8C0R0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp37Q8C0R0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp37Q8C0R0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp37Q8C0R0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp37Q8C0R0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp37Q8C0R0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp37Q8C0R0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp37Q8C0R0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp37Q8C0R0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp37Q8C0R0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp37Q8C0R0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp37Q8C0R0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp37Q8C0R0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp37Q8C0R0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp37Q8C0R0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp37Q8C0R0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp37Q8C0R0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp37Q8C0R0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp37Q8C0R0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp37Q8C0R0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp37Q8C0R0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp37Q8C0R0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp37Q8C0R0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp37Q8C0R0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp37Q8C0R0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp37Q8C0R0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp37Q8C0R0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp37Q8C0R0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp37Q8C0R0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp37Q8C0R0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp37Q8C0R0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp37Q8C0R0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp37Q8C0R0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp37Q8C0R0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp37Q8C0R0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp37Q8C0R0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp37Q8C0R0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp37Q8C0R0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp37Q8C0R0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp37Q8C0R0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp37Q8C0R0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp37Q8C0R0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp37Q8C0R0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp37Q8C0R0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp37Q8C0R0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp37Q8C0R0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp37Q8C0R0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp37Q8C0R0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp37Q8C0R0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp37Q8C0R0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp37Q8C0R0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp37Q8C0R0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp37Q8C0R0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp37Q8C0R0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp37Q8C0R0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp37Q8C0R0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp37Q8C0R0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp37Q8C0R0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp37Q8C0R0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp37Q8C0R0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp37Q8C0R0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp37Q8C0R0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp37Q8C0R0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp37Q8C0R0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp37Q8C0R0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp37Q8C0R0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp37Q8C0R0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp37Q8C0R0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp37Q8C0R0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp37Q8C0R0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp37Q8C0R0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp37Q8C0R0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp37Q8C0R0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp37Q8C0R0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp37Q8C0R0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp37Q8C0R0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp37Q8C0R0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp37Q8C0R0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp37Q8C0R0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Usp37Q8C0R0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Usp37Q8C0R0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms