Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg16l1Q8C0J2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg16l1Q8C0J2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg16l1Q8C0J2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg16l1Q8C0J2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg16l1Q8C0J2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg16l1Q8C0J2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg16l1Q8C0J2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg16l1Q8C0J2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg16l1Q8C0J2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg16l1Q8C0J2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg16l1Q8C0J2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg16l1Q8C0J2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg16l1Q8C0J2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg16l1Q8C0J2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg16l1Q8C0J2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg16l1Q8C0J2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg16l1Q8C0J2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg16l1Q8C0J2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg16l1Q8C0J2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg16l1Q8C0J2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg16l1Q8C0J2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg16l1Q8C0J2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg16l1Q8C0J2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg16l1Q8C0J2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg16l1Q8C0J2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg16l1Q8C0J2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg16l1Q8C0J2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg16l1Q8C0J2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg16l1Q8C0J2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg16l1Q8C0J2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg16l1Q8C0J2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg16l1Q8C0J2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg16l1Q8C0J2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg16l1Q8C0J2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg16l1Q8C0J2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg16l1Q8C0J2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg16l1Q8C0J2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg16l1Q8C0J2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg16l1Q8C0J2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg16l1Q8C0J2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Atg16l1Q8C0J2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Atg16l1Q8C0J2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atg16l1Q8C0J2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg16l1Q8C0J2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atg16l1Q8C0J2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg16l1Q8C0J2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg16l1Q8C0J2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg16l1Q8C0J2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Atg16l1Q8C0J2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg16l1Q8C0J2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg16l1Q8C0J2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Atg16l1Q8C0J2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Atg16l1Q8C0J2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Atg16l1Q8C0J2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Atg16l1Q8C0J2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg16l1Q8C0J2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg16l1Q8C0J2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg16l1Q8C0J2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg16l1Q8C0J2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg16l1Q8C0J2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg16l1Q8C0J2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg16l1Q8C0J2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg16l1Q8C0J2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg16l1Q8C0J2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Atg16l1Q8C0J2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Atg16l1Q8C0J2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atg16l1Q8C0J2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg16l1Q8C0J2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg16l1Q8C0J2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg16l1Q8C0J2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atg16l1Q8C0J2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atg16l1Q8C0J2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Atg16l1Q8C0J2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atg16l1Q8C0J2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Atg16l1Q8C0J2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Atg16l1Q8C0J2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Atg16l1Q8C0J2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Atg16l1Q8C0J2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg16l1Q8C0J2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg16l1Q8C0J2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg16l1Q8C0J2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg16l1Q8C0J2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg16l1Q8C0J2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg16l1Q8C0J2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg16l1Q8C0J2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg16l1Q8C0J2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg16l1Q8C0J2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg16l1Q8C0J2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg16l1Q8C0J2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg16l1Q8C0J2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg16l1Q8C0J2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg16l1Q8C0J2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg16l1Q8C0J2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg16l1Q8C0J2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg16l1Q8C0J2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg16l1Q8C0J2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg16l1Q8C0J2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg16l1Q8C0J2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg16l1Q8C0J2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms