Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccser1Q8C0C4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccser1Q8C0C4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccser1Q8C0C4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccser1Q8C0C4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccser1Q8C0C4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccser1Q8C0C4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccser1Q8C0C4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccser1Q8C0C4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccser1Q8C0C4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccser1Q8C0C4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccser1Q8C0C4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccser1Q8C0C4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccser1Q8C0C4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccser1Q8C0C4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccser1Q8C0C4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccser1Q8C0C4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccser1Q8C0C4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccser1Q8C0C4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccser1Q8C0C4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccser1Q8C0C4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccser1Q8C0C4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccser1Q8C0C4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccser1Q8C0C4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccser1Q8C0C4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccser1Q8C0C4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccser1Q8C0C4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccser1Q8C0C4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccser1Q8C0C4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccser1Q8C0C4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccser1Q8C0C4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccser1Q8C0C4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccser1Q8C0C4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccser1Q8C0C4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccser1Q8C0C4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccser1Q8C0C4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccser1Q8C0C4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccser1Q8C0C4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccser1Q8C0C4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccser1Q8C0C4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccser1Q8C0C4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccser1Q8C0C4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccser1Q8C0C4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccser1Q8C0C4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccser1Q8C0C4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccser1Q8C0C4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccser1Q8C0C4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccser1Q8C0C4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccser1Q8C0C4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccser1Q8C0C4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccser1Q8C0C4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccser1Q8C0C4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccser1Q8C0C4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccser1Q8C0C4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccser1Q8C0C4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccser1Q8C0C4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccser1Q8C0C4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccser1Q8C0C4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccser1Q8C0C4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccser1Q8C0C4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccser1Q8C0C4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccser1Q8C0C4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccser1Q8C0C4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccser1Q8C0C4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccser1Q8C0C4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccser1Q8C0C4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccser1Q8C0C4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccser1Q8C0C4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccser1Q8C0C4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccser1Q8C0C4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccser1Q8C0C4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccser1Q8C0C4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccser1Q8C0C4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccser1Q8C0C4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccser1Q8C0C4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccser1Q8C0C4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccser1Q8C0C4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccser1Q8C0C4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccser1Q8C0C4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccser1Q8C0C4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccser1Q8C0C4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccser1Q8C0C4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccser1Q8C0C4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccser1Q8C0C4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccser1Q8C0C4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccser1Q8C0C4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccser1Q8C0C4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccser1Q8C0C4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccser1Q8C0C4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccser1Q8C0C4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccser1Q8C0C4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccser1Q8C0C4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccser1Q8C0C4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccser1Q8C0C4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccser1Q8C0C4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccser1Q8C0C4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccser1Q8C0C4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccser1Q8C0C4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccser1Q8C0C4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccser1Q8C0C4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms