Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUN5

Smad3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad3Q8BUN5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smad3Q8BUN5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smad3Q8BUN5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smad3Q8BUN5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smad3Q8BUN5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smad3Q8BUN5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smad3Q8BUN5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Smad3Q8BUN5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smad3Q8BUN5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smad3Q8BUN5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smad3Q8BUN5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smad3Q8BUN5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smad3Q8BUN5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smad3Q8BUN5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smad3Q8BUN5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smad3Q8BUN5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smad3Q8BUN5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smad3Q8BUN5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smad3Q8BUN5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smad3Q8BUN5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smad3Q8BUN5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smad3Q8BUN5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smad3Q8BUN5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smad3Q8BUN5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smad3Q8BUN5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smad3Q8BUN5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smad3Q8BUN5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smad3Q8BUN5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smad3Q8BUN5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smad3Q8BUN5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smad3Q8BUN5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Smad3Q8BUN5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smad3Q8BUN5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smad3Q8BUN5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smad3Q8BUN5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smad3Q8BUN5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smad3Q8BUN5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smad3Q8BUN5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smad3Q8BUN5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smad3Q8BUN5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smad3Q8BUN5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smad3Q8BUN5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smad3Q8BUN5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smad3Q8BUN5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smad3Q8BUN5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smad3Q8BUN5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smad3Q8BUN5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smad3Q8BUN5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smad3Q8BUN5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Smad3Q8BUN5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Smad3Q8BUN5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Smad3Q8BUN5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smad3Q8BUN5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smad3Q8BUN5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smad3Q8BUN5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smad3Q8BUN5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smad3Q8BUN5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smad3Q8BUN5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smad3Q8BUN5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smad3Q8BUN5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smad3Q8BUN5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smad3Q8BUN5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smad3Q8BUN5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smad3Q8BUN5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smad3Q8BUN5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smad3Q8BUN5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Smad3Q8BUN5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smad3Q8BUN5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Smad3Q8BUN5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Smad3Q8BUN5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smad3Q8BUN5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smad3Q8BUN5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smad3Q8BUN5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smad3Q8BUN5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smad3Q8BUN5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smad3Q8BUN5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smad3Q8BUN5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smad3Q8BUN5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smad3Q8BUN5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smad3Q8BUN5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smad3Q8BUN5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Smad3Q8BUN5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smad3Q8BUN5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smad3Q8BUN5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smad3Q8BUN5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smad3Q8BUN5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Smad3Q8BUN5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Smad3Q8BUN5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smad3Q8BUN5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smad3Q8BUN5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smad3Q8BUN5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smad3Q8BUN5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smad3Q8BUN5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smad3Q8BUN5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smad3Q8BUN5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smad3Q8BUN5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smad3Q8BUN5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smad3Q8BUN5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smad3Q8BUN5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smad3Q8BUN5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms