Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTV2

Cpsf7, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf7Q8BTV2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpsf7Q8BTV2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpsf7Q8BTV2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpsf7Q8BTV2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpsf7Q8BTV2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpsf7Q8BTV2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpsf7Q8BTV2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpsf7Q8BTV2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpsf7Q8BTV2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpsf7Q8BTV2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpsf7Q8BTV2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpsf7Q8BTV2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpsf7Q8BTV2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpsf7Q8BTV2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpsf7Q8BTV2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpsf7Q8BTV2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpsf7Q8BTV2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpsf7Q8BTV2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpsf7Q8BTV2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpsf7Q8BTV2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpsf7Q8BTV2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpsf7Q8BTV2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpsf7Q8BTV2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpsf7Q8BTV2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpsf7Q8BTV2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpsf7Q8BTV2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpsf7Q8BTV2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpsf7Q8BTV2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpsf7Q8BTV2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpsf7Q8BTV2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpsf7Q8BTV2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpsf7Q8BTV2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cpsf7Q8BTV2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cpsf7Q8BTV2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cpsf7Q8BTV2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cpsf7Q8BTV2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cpsf7Q8BTV2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cpsf7Q8BTV2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cpsf7Q8BTV2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cpsf7Q8BTV2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cpsf7Q8BTV2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cpsf7Q8BTV2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpsf7Q8BTV2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpsf7Q8BTV2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpsf7Q8BTV2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpsf7Q8BTV2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpsf7Q8BTV2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpsf7Q8BTV2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpsf7Q8BTV2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpsf7Q8BTV2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpsf7Q8BTV2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpsf7Q8BTV2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpsf7Q8BTV2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpsf7Q8BTV2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpsf7Q8BTV2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cpsf7Q8BTV2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cpsf7Q8BTV2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cpsf7Q8BTV2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cpsf7Q8BTV2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpsf7Q8BTV2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpsf7Q8BTV2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpsf7Q8BTV2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpsf7Q8BTV2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpsf7Q8BTV2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpsf7Q8BTV2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpsf7Q8BTV2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpsf7Q8BTV2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpsf7Q8BTV2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpsf7Q8BTV2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cpsf7Q8BTV2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cpsf7Q8BTV2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cpsf7Q8BTV2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cpsf7Q8BTV2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cpsf7Q8BTV2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cpsf7Q8BTV2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cpsf7Q8BTV2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cpsf7Q8BTV2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cpsf7Q8BTV2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cpsf7Q8BTV2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cpsf7Q8BTV2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cpsf7Q8BTV2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cpsf7Q8BTV2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cpsf7Q8BTV2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Cpsf7Q8BTV2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cpsf7Q8BTV2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cpsf7Q8BTV2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cpsf7Q8BTV2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cpsf7Q8BTV2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cpsf7Q8BTV2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cpsf7Q8BTV2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cpsf7Q8BTV2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cpsf7Q8BTV2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cpsf7Q8BTV2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cpsf7Q8BTV2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cpsf7Q8BTV2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cpsf7Q8BTV2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cpsf7Q8BTV2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cpsf7Q8BTV2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cpsf7Q8BTV2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cpsf7Q8BTV2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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