Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTF7

Lig4, DNA ligase 4, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig4Q8BTF7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lig4Q8BTF7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lig4Q8BTF7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Lig4Q8BTF7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lig4Q8BTF7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lig4Q8BTF7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Lig4Q8BTF7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lig4Q8BTF7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lig4Q8BTF7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lig4Q8BTF7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lig4Q8BTF7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lig4Q8BTF7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lig4Q8BTF7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lig4Q8BTF7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lig4Q8BTF7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lig4Q8BTF7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lig4Q8BTF7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lig4Q8BTF7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lig4Q8BTF7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lig4Q8BTF7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lig4Q8BTF7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lig4Q8BTF7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lig4Q8BTF7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lig4Q8BTF7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lig4Q8BTF7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lig4Q8BTF7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lig4Q8BTF7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Lig4Q8BTF7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lig4Q8BTF7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Lig4Q8BTF7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lig4Q8BTF7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Lig4Q8BTF7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lig4Q8BTF7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lig4Q8BTF7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lig4Q8BTF7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lig4Q8BTF7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lig4Q8BTF7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lig4Q8BTF7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lig4Q8BTF7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lig4Q8BTF7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lig4Q8BTF7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lig4Q8BTF7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lig4Q8BTF7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lig4Q8BTF7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lig4Q8BTF7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lig4Q8BTF7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lig4Q8BTF7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lig4Q8BTF7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lig4Q8BTF7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lig4Q8BTF7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lig4Q8BTF7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lig4Q8BTF7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lig4Q8BTF7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lig4Q8BTF7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lig4Q8BTF7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lig4Q8BTF7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lig4Q8BTF7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lig4Q8BTF7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Lig4Q8BTF7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lig4Q8BTF7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lig4Q8BTF7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lig4Q8BTF7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lig4Q8BTF7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lig4Q8BTF7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lig4Q8BTF7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lig4Q8BTF7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lig4Q8BTF7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lig4Q8BTF7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lig4Q8BTF7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lig4Q8BTF7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lig4Q8BTF7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lig4Q8BTF7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lig4Q8BTF7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lig4Q8BTF7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lig4Q8BTF7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lig4Q8BTF7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lig4Q8BTF7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lig4Q8BTF7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lig4Q8BTF7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lig4Q8BTF7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lig4Q8BTF7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lig4Q8BTF7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lig4Q8BTF7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lig4Q8BTF7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lig4Q8BTF7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lig4Q8BTF7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lig4Q8BTF7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lig4Q8BTF7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lig4Q8BTF7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lig4Q8BTF7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lig4Q8BTF7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lig4Q8BTF7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Lig4Q8BTF7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lig4Q8BTF7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lig4Q8BTF7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lig4Q8BTF7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lig4Q8BTF7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lig4Q8BTF7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lig4Q8BTF7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lig4Q8BTF7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.3 ms