Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cep55Q8BT07 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Cep55Q8BT07 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cep55Q8BT07 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cep55Q8BT07 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cep55Q8BT07 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cep55Q8BT07 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cep55Q8BT07 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cep55Q8BT07 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cep55Q8BT07 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cep55Q8BT07 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cep55Q8BT07 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cep55Q8BT07 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cep55Q8BT07 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cep55Q8BT07 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cep55Q8BT07 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cep55Q8BT07 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cep55Q8BT07 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cep55Q8BT07 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cep55Q8BT07 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cep55Q8BT07 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Cep55Q8BT07 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cep55Q8BT07 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cep55Q8BT07 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cep55Q8BT07 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cep55Q8BT07 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cep55Q8BT07 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cep55Q8BT07 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cep55Q8BT07 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cep55Q8BT07 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cep55Q8BT07 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cep55Q8BT07 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cep55Q8BT07 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cep55Q8BT07 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cep55Q8BT07 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cep55Q8BT07 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cep55Q8BT07 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cep55Q8BT07 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cep55Q8BT07 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cep55Q8BT07 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cep55Q8BT07 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cep55Q8BT07 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cep55Q8BT07 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Cep55Q8BT07 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cep55Q8BT07 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cep55Q8BT07 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cep55Q8BT07 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cep55Q8BT07 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cep55Q8BT07 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Cep55Q8BT07 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cep55Q8BT07 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cep55Q8BT07 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cep55Q8BT07 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cep55Q8BT07 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cep55Q8BT07 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cep55Q8BT07 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cep55Q8BT07 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cep55Q8BT07 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cep55Q8BT07 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cep55Q8BT07 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cep55Q8BT07 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cep55Q8BT07 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cep55Q8BT07 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Cep55Q8BT07 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cep55Q8BT07 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cep55Q8BT07 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cep55Q8BT07 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cep55Q8BT07 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cep55Q8BT07 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cep55Q8BT07 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cep55Q8BT07 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cep55Q8BT07 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cep55Q8BT07 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cep55Q8BT07 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cep55Q8BT07 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cep55Q8BT07 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cep55Q8BT07 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cep55Q8BT07 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cep55Q8BT07 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cep55Q8BT07 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cep55Q8BT07 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cep55Q8BT07 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cep55Q8BT07 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cep55Q8BT07 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cep55Q8BT07 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cep55Q8BT07 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cep55Q8BT07 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cep55Q8BT07 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cep55Q8BT07 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cep55Q8BT07 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Cep55Q8BT07 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cep55Q8BT07 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cep55Q8BT07 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cep55Q8BT07 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cep55Q8BT07 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cep55Q8BT07 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cep55Q8BT07 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cep55Q8BT07 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cep55Q8BT07 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cep55Q8BT07 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms