Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSQ9

Pbrm1, Protein polybromo-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbrm1Q8BSQ9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Pbrm1Q8BSQ9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Pbrm1Q8BSQ9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Pbrm1Q8BSQ9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Pbrm1Q8BSQ9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Pbrm1Q8BSQ9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Pbrm1Q8BSQ9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Pbrm1Q8BSQ9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Pbrm1Q8BSQ9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Pbrm1Q8BSQ9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Pbrm1Q8BSQ9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Pbrm1Q8BSQ9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Pbrm1Q8BSQ9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Pbrm1Q8BSQ9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Pbrm1Q8BSQ9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Pbrm1Q8BSQ9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Pbrm1Q8BSQ9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Pbrm1Q8BSQ9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Pbrm1Q8BSQ9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Pbrm1Q8BSQ9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Pbrm1Q8BSQ9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Pbrm1Q8BSQ9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Pbrm1Q8BSQ9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Pbrm1Q8BSQ9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Pbrm1Q8BSQ9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Pbrm1Q8BSQ9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Pbrm1Q8BSQ9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Pbrm1Q8BSQ9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
Pbrm1Q8BSQ9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Pbrm1Q8BSQ9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.15
Pbrm1Q8BSQ9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
Pbrm1Q8BSQ9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Pbrm1Q8BSQ9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Pbrm1Q8BSQ9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Pbrm1Q8BSQ9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Pbrm1Q8BSQ9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
Pbrm1Q8BSQ9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Pbrm1Q8BSQ9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
Pbrm1Q8BSQ9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Pbrm1Q8BSQ9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Pbrm1Q8BSQ9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Pbrm1Q8BSQ9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Pbrm1Q8BSQ9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Pbrm1Q8BSQ9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Pbrm1Q8BSQ9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
Pbrm1Q8BSQ9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Pbrm1Q8BSQ9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Pbrm1Q8BSQ9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Pbrm1Q8BSQ9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Pbrm1Q8BSQ9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Pbrm1Q8BSQ9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Pbrm1Q8BSQ9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Pbrm1Q8BSQ9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Pbrm1Q8BSQ9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Pbrm1Q8BSQ9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Pbrm1Q8BSQ9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Pbrm1Q8BSQ9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Pbrm1Q8BSQ9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC34.7■■■■□ 3.14
Pbrm1Q8BSQ9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Pbrm1Q8BSQ9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Pbrm1Q8BSQ9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Pbrm1Q8BSQ9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Pbrm1Q8BSQ9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Pbrm1Q8BSQ9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Pbrm1Q8BSQ9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
Pbrm1Q8BSQ9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Pbrm1Q8BSQ9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
Pbrm1Q8BSQ9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Pbrm1Q8BSQ9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Pbrm1Q8BSQ9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Pbrm1Q8BSQ9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Pbrm1Q8BSQ9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Pbrm1Q8BSQ9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Pbrm1Q8BSQ9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Pbrm1Q8BSQ9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Pbrm1Q8BSQ9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Pbrm1Q8BSQ9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Pbrm1Q8BSQ9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Pbrm1Q8BSQ9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Pbrm1Q8BSQ9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Pbrm1Q8BSQ9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Pbrm1Q8BSQ9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Pbrm1Q8BSQ9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Pbrm1Q8BSQ9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Pbrm1Q8BSQ9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Pbrm1Q8BSQ9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Pbrm1Q8BSQ9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Pbrm1Q8BSQ9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Pbrm1Q8BSQ9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Pbrm1Q8BSQ9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Pbrm1Q8BSQ9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Pbrm1Q8BSQ9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Pbrm1Q8BSQ9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Pbrm1Q8BSQ9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
Pbrm1Q8BSQ9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Pbrm1Q8BSQ9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Pbrm1Q8BSQ9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Pbrm1Q8BSQ9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms