Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ08

5730596B20Rik, RIKEN cDNA 5730596B20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730596B20RikQ8BQ08 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
5730596B20RikQ8BQ08 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
5730596B20RikQ8BQ08 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
5730596B20RikQ8BQ08 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms