Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ2

Gtf3c4, General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4Q8BMQ2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf3c4Q8BMQ2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf3c4Q8BMQ2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf3c4Q8BMQ2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf3c4Q8BMQ2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf3c4Q8BMQ2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf3c4Q8BMQ2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf3c4Q8BMQ2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf3c4Q8BMQ2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf3c4Q8BMQ2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf3c4Q8BMQ2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf3c4Q8BMQ2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf3c4Q8BMQ2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf3c4Q8BMQ2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf3c4Q8BMQ2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf3c4Q8BMQ2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf3c4Q8BMQ2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf3c4Q8BMQ2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf3c4Q8BMQ2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf3c4Q8BMQ2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf3c4Q8BMQ2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf3c4Q8BMQ2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf3c4Q8BMQ2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf3c4Q8BMQ2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf3c4Q8BMQ2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf3c4Q8BMQ2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gtf3c4Q8BMQ2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf3c4Q8BMQ2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf3c4Q8BMQ2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf3c4Q8BMQ2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf3c4Q8BMQ2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf3c4Q8BMQ2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gtf3c4Q8BMQ2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf3c4Q8BMQ2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf3c4Q8BMQ2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf3c4Q8BMQ2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf3c4Q8BMQ2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf3c4Q8BMQ2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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