Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLH7

Hirip3, HIRA-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hirip3Q8BLH7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hirip3Q8BLH7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Hirip3Q8BLH7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hirip3Q8BLH7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hirip3Q8BLH7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hirip3Q8BLH7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hirip3Q8BLH7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hirip3Q8BLH7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hirip3Q8BLH7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hirip3Q8BLH7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hirip3Q8BLH7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hirip3Q8BLH7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hirip3Q8BLH7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hirip3Q8BLH7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hirip3Q8BLH7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hirip3Q8BLH7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hirip3Q8BLH7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hirip3Q8BLH7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hirip3Q8BLH7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Hirip3Q8BLH7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hirip3Q8BLH7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hirip3Q8BLH7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hirip3Q8BLH7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hirip3Q8BLH7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hirip3Q8BLH7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hirip3Q8BLH7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hirip3Q8BLH7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hirip3Q8BLH7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hirip3Q8BLH7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hirip3Q8BLH7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hirip3Q8BLH7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hirip3Q8BLH7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hirip3Q8BLH7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hirip3Q8BLH7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hirip3Q8BLH7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hirip3Q8BLH7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Hirip3Q8BLH7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hirip3Q8BLH7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hirip3Q8BLH7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hirip3Q8BLH7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hirip3Q8BLH7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hirip3Q8BLH7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hirip3Q8BLH7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hirip3Q8BLH7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hirip3Q8BLH7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hirip3Q8BLH7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hirip3Q8BLH7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hirip3Q8BLH7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hirip3Q8BLH7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hirip3Q8BLH7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hirip3Q8BLH7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hirip3Q8BLH7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hirip3Q8BLH7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hirip3Q8BLH7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Hirip3Q8BLH7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hirip3Q8BLH7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hirip3Q8BLH7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Hirip3Q8BLH7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hirip3Q8BLH7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hirip3Q8BLH7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hirip3Q8BLH7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hirip3Q8BLH7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hirip3Q8BLH7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hirip3Q8BLH7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hirip3Q8BLH7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hirip3Q8BLH7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hirip3Q8BLH7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hirip3Q8BLH7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Hirip3Q8BLH7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hirip3Q8BLH7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Hirip3Q8BLH7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hirip3Q8BLH7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hirip3Q8BLH7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hirip3Q8BLH7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hirip3Q8BLH7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hirip3Q8BLH7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hirip3Q8BLH7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hirip3Q8BLH7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hirip3Q8BLH7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hirip3Q8BLH7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hirip3Q8BLH7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hirip3Q8BLH7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hirip3Q8BLH7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Hirip3Q8BLH7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hirip3Q8BLH7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hirip3Q8BLH7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hirip3Q8BLH7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hirip3Q8BLH7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hirip3Q8BLH7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hirip3Q8BLH7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hirip3Q8BLH7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hirip3Q8BLH7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hirip3Q8BLH7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hirip3Q8BLH7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Hirip3Q8BLH7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hirip3Q8BLH7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hirip3Q8BLH7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Hirip3Q8BLH7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Hirip3Q8BLH7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hirip3Q8BLH7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms