Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Zcchc4Q8BKW4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Zcchc4Q8BKW4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Zcchc4Q8BKW4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Zcchc4Q8BKW4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Zcchc4Q8BKW4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Zcchc4Q8BKW4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Zcchc4Q8BKW4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Zcchc4Q8BKW4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Zcchc4Q8BKW4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Zcchc4Q8BKW4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Zcchc4Q8BKW4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Zcchc4Q8BKW4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Zcchc4Q8BKW4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Zcchc4Q8BKW4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Zcchc4Q8BKW4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Zcchc4Q8BKW4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Zcchc4Q8BKW4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Zcchc4Q8BKW4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Zcchc4Q8BKW4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Zcchc4Q8BKW4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Zcchc4Q8BKW4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Zcchc4Q8BKW4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Zcchc4Q8BKW4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Zcchc4Q8BKW4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zcchc4Q8BKW4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zcchc4Q8BKW4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zcchc4Q8BKW4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zcchc4Q8BKW4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zcchc4Q8BKW4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zcchc4Q8BKW4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Zcchc4Q8BKW4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zcchc4Q8BKW4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zcchc4Q8BKW4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Zcchc4Q8BKW4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Zcchc4Q8BKW4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zcchc4Q8BKW4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zcchc4Q8BKW4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zcchc4Q8BKW4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zcchc4Q8BKW4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Zcchc4Q8BKW4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Zcchc4Q8BKW4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zcchc4Q8BKW4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zcchc4Q8BKW4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zcchc4Q8BKW4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zcchc4Q8BKW4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Zcchc4Q8BKW4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Zcchc4Q8BKW4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Zcchc4Q8BKW4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Zcchc4Q8BKW4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Zcchc4Q8BKW4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Zcchc4Q8BKW4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Zcchc4Q8BKW4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Zcchc4Q8BKW4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Zcchc4Q8BKW4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Zcchc4Q8BKW4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Zcchc4Q8BKW4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Zcchc4Q8BKW4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Zcchc4Q8BKW4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Zcchc4Q8BKW4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Zcchc4Q8BKW4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Zcchc4Q8BKW4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Zcchc4Q8BKW4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Zcchc4Q8BKW4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Zcchc4Q8BKW4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Zcchc4Q8BKW4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Zcchc4Q8BKW4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Zcchc4Q8BKW4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Zcchc4Q8BKW4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Zcchc4Q8BKW4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Zcchc4Q8BKW4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Zcchc4Q8BKW4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Zcchc4Q8BKW4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Zcchc4Q8BKW4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Zcchc4Q8BKW4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Zcchc4Q8BKW4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Zcchc4Q8BKW4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Zcchc4Q8BKW4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Zcchc4Q8BKW4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Zcchc4Q8BKW4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Zcchc4Q8BKW4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Zcchc4Q8BKW4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Zcchc4Q8BKW4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Zcchc4Q8BKW4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Zcchc4Q8BKW4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Zcchc4Q8BKW4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Zcchc4Q8BKW4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Zcchc4Q8BKW4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Zcchc4Q8BKW4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Zcchc4Q8BKW4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Zcchc4Q8BKW4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Zcchc4Q8BKW4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Zcchc4Q8BKW4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Zcchc4Q8BKW4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Zcchc4Q8BKW4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Zcchc4Q8BKW4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Zcchc4Q8BKW4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Zcchc4Q8BKW4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Zcchc4Q8BKW4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Zcchc4Q8BKW4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms