Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIE6

Frmd4a, FERM domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd4aQ8BIE6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Frmd4aQ8BIE6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Frmd4aQ8BIE6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Frmd4aQ8BIE6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Frmd4aQ8BIE6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Frmd4aQ8BIE6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmd4aQ8BIE6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmd4aQ8BIE6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmd4aQ8BIE6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmd4aQ8BIE6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmd4aQ8BIE6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmd4aQ8BIE6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmd4aQ8BIE6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmd4aQ8BIE6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmd4aQ8BIE6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmd4aQ8BIE6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmd4aQ8BIE6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmd4aQ8BIE6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmd4aQ8BIE6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmd4aQ8BIE6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Frmd4aQ8BIE6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Frmd4aQ8BIE6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Frmd4aQ8BIE6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Frmd4aQ8BIE6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Frmd4aQ8BIE6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Frmd4aQ8BIE6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Frmd4aQ8BIE6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Frmd4aQ8BIE6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Frmd4aQ8BIE6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Frmd4aQ8BIE6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Frmd4aQ8BIE6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Frmd4aQ8BIE6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Frmd4aQ8BIE6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Frmd4aQ8BIE6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Frmd4aQ8BIE6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Frmd4aQ8BIE6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Frmd4aQ8BIE6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Frmd4aQ8BIE6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Frmd4aQ8BIE6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Frmd4aQ8BIE6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Frmd4aQ8BIE6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Frmd4aQ8BIE6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Frmd4aQ8BIE6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Frmd4aQ8BIE6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Frmd4aQ8BIE6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Frmd4aQ8BIE6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Frmd4aQ8BIE6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Frmd4aQ8BIE6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frmd4aQ8BIE6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frmd4aQ8BIE6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frmd4aQ8BIE6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Frmd4aQ8BIE6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Frmd4aQ8BIE6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Frmd4aQ8BIE6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Frmd4aQ8BIE6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmd4aQ8BIE6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmd4aQ8BIE6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmd4aQ8BIE6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmd4aQ8BIE6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmd4aQ8BIE6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmd4aQ8BIE6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmd4aQ8BIE6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmd4aQ8BIE6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmd4aQ8BIE6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmd4aQ8BIE6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmd4aQ8BIE6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmd4aQ8BIE6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmd4aQ8BIE6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmd4aQ8BIE6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmd4aQ8BIE6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmd4aQ8BIE6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmd4aQ8BIE6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmd4aQ8BIE6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmd4aQ8BIE6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmd4aQ8BIE6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmd4aQ8BIE6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmd4aQ8BIE6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmd4aQ8BIE6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmd4aQ8BIE6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmd4aQ8BIE6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmd4aQ8BIE6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmd4aQ8BIE6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmd4aQ8BIE6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmd4aQ8BIE6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmd4aQ8BIE6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmd4aQ8BIE6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmd4aQ8BIE6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmd4aQ8BIE6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmd4aQ8BIE6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmd4aQ8BIE6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmd4aQ8BIE6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmd4aQ8BIE6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmd4aQ8BIE6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmd4aQ8BIE6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Frmd4aQ8BIE6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Frmd4aQ8BIE6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Frmd4aQ8BIE6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Frmd4aQ8BIE6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Frmd4aQ8BIE6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Frmd4aQ8BIE6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms