Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH55

Thnsl1, Threonine synthase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thnsl1Q8BH55 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Thnsl1Q8BH55 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Thnsl1Q8BH55 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Thnsl1Q8BH55 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Thnsl1Q8BH55 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Thnsl1Q8BH55 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Thnsl1Q8BH55 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Thnsl1Q8BH55 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Thnsl1Q8BH55 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Thnsl1Q8BH55 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Thnsl1Q8BH55 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Thnsl1Q8BH55 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Thnsl1Q8BH55 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Thnsl1Q8BH55 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Thnsl1Q8BH55 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Thnsl1Q8BH55 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Thnsl1Q8BH55 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Thnsl1Q8BH55 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Thnsl1Q8BH55 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Thnsl1Q8BH55 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Thnsl1Q8BH55 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Thnsl1Q8BH55 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Thnsl1Q8BH55 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Thnsl1Q8BH55 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Thnsl1Q8BH55 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Thnsl1Q8BH55 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Thnsl1Q8BH55 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Thnsl1Q8BH55 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Thnsl1Q8BH55 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Thnsl1Q8BH55 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Thnsl1Q8BH55 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Thnsl1Q8BH55 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Thnsl1Q8BH55 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Thnsl1Q8BH55 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Thnsl1Q8BH55 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Thnsl1Q8BH55 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Thnsl1Q8BH55 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Thnsl1Q8BH55 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Thnsl1Q8BH55 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Thnsl1Q8BH55 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Thnsl1Q8BH55 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Thnsl1Q8BH55 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Thnsl1Q8BH55 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Thnsl1Q8BH55 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Thnsl1Q8BH55 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Thnsl1Q8BH55 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Thnsl1Q8BH55 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Thnsl1Q8BH55 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Thnsl1Q8BH55 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Thnsl1Q8BH55 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Thnsl1Q8BH55 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Thnsl1Q8BH55 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Thnsl1Q8BH55 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Thnsl1Q8BH55 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Thnsl1Q8BH55 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Thnsl1Q8BH55 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Thnsl1Q8BH55 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Thnsl1Q8BH55 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Thnsl1Q8BH55 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Thnsl1Q8BH55 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Thnsl1Q8BH55 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Thnsl1Q8BH55 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Thnsl1Q8BH55 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Thnsl1Q8BH55 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Thnsl1Q8BH55 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Thnsl1Q8BH55 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Thnsl1Q8BH55 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Thnsl1Q8BH55 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Thnsl1Q8BH55 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Thnsl1Q8BH55 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Thnsl1Q8BH55 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Thnsl1Q8BH55 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Thnsl1Q8BH55 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Thnsl1Q8BH55 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Thnsl1Q8BH55 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Thnsl1Q8BH55 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Thnsl1Q8BH55 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Thnsl1Q8BH55 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Thnsl1Q8BH55 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Thnsl1Q8BH55 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Thnsl1Q8BH55 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Thnsl1Q8BH55 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Thnsl1Q8BH55 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Thnsl1Q8BH55 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Thnsl1Q8BH55 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Thnsl1Q8BH55 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Thnsl1Q8BH55 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Thnsl1Q8BH55 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Thnsl1Q8BH55 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Thnsl1Q8BH55 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Thnsl1Q8BH55 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Thnsl1Q8BH55 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Thnsl1Q8BH55 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Thnsl1Q8BH55 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Thnsl1Q8BH55 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Thnsl1Q8BH55 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Thnsl1Q8BH55 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Thnsl1Q8BH55 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Thnsl1Q8BH55 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Thnsl1Q8BH55 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms