Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubash3bQ8BGG7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubash3bQ8BGG7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubash3bQ8BGG7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubash3bQ8BGG7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubash3bQ8BGG7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubash3bQ8BGG7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubash3bQ8BGG7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubash3bQ8BGG7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubash3bQ8BGG7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubash3bQ8BGG7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubash3bQ8BGG7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubash3bQ8BGG7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubash3bQ8BGG7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubash3bQ8BGG7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ubash3bQ8BGG7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ubash3bQ8BGG7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ubash3bQ8BGG7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubash3bQ8BGG7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubash3bQ8BGG7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubash3bQ8BGG7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubash3bQ8BGG7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubash3bQ8BGG7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubash3bQ8BGG7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubash3bQ8BGG7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubash3bQ8BGG7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubash3bQ8BGG7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubash3bQ8BGG7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubash3bQ8BGG7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubash3bQ8BGG7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubash3bQ8BGG7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubash3bQ8BGG7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubash3bQ8BGG7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubash3bQ8BGG7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubash3bQ8BGG7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubash3bQ8BGG7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubash3bQ8BGG7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubash3bQ8BGG7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubash3bQ8BGG7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubash3bQ8BGG7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubash3bQ8BGG7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubash3bQ8BGG7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubash3bQ8BGG7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubash3bQ8BGG7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubash3bQ8BGG7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubash3bQ8BGG7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubash3bQ8BGG7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubash3bQ8BGG7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubash3bQ8BGG7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubash3bQ8BGG7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubash3bQ8BGG7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubash3bQ8BGG7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubash3bQ8BGG7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ubash3bQ8BGG7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubash3bQ8BGG7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubash3bQ8BGG7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubash3bQ8BGG7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubash3bQ8BGG7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubash3bQ8BGG7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubash3bQ8BGG7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubash3bQ8BGG7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ubash3bQ8BGG7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ubash3bQ8BGG7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ubash3bQ8BGG7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ubash3bQ8BGG7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ubash3bQ8BGG7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ubash3bQ8BGG7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ubash3bQ8BGG7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ubash3bQ8BGG7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ubash3bQ8BGG7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubash3bQ8BGG7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubash3bQ8BGG7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubash3bQ8BGG7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubash3bQ8BGG7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubash3bQ8BGG7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubash3bQ8BGG7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubash3bQ8BGG7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubash3bQ8BGG7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubash3bQ8BGG7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubash3bQ8BGG7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubash3bQ8BGG7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubash3bQ8BGG7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubash3bQ8BGG7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubash3bQ8BGG7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubash3bQ8BGG7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubash3bQ8BGG7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubash3bQ8BGG7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubash3bQ8BGG7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubash3bQ8BGG7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubash3bQ8BGG7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubash3bQ8BGG7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubash3bQ8BGG7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubash3bQ8BGG7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubash3bQ8BGG7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubash3bQ8BGG7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubash3bQ8BGG7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubash3bQ8BGG7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubash3bQ8BGG7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubash3bQ8BGG7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubash3bQ8BGG7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms