Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG99

Pknox2, Homeobox protein PKNOX2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox2Q8BG99 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pknox2Q8BG99 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pknox2Q8BG99 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pknox2Q8BG99 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pknox2Q8BG99 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pknox2Q8BG99 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pknox2Q8BG99 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pknox2Q8BG99 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pknox2Q8BG99 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pknox2Q8BG99 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pknox2Q8BG99 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pknox2Q8BG99 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pknox2Q8BG99 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Pknox2Q8BG99 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pknox2Q8BG99 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pknox2Q8BG99 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pknox2Q8BG99 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pknox2Q8BG99 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pknox2Q8BG99 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pknox2Q8BG99 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pknox2Q8BG99 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pknox2Q8BG99 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pknox2Q8BG99 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pknox2Q8BG99 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pknox2Q8BG99 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pknox2Q8BG99 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pknox2Q8BG99 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pknox2Q8BG99 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pknox2Q8BG99 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pknox2Q8BG99 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pknox2Q8BG99 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pknox2Q8BG99 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pknox2Q8BG99 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pknox2Q8BG99 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pknox2Q8BG99 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Pknox2Q8BG99 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pknox2Q8BG99 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pknox2Q8BG99 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pknox2Q8BG99 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pknox2Q8BG99 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pknox2Q8BG99 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pknox2Q8BG99 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pknox2Q8BG99 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pknox2Q8BG99 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pknox2Q8BG99 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pknox2Q8BG99 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pknox2Q8BG99 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pknox2Q8BG99 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pknox2Q8BG99 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pknox2Q8BG99 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pknox2Q8BG99 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pknox2Q8BG99 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pknox2Q8BG99 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pknox2Q8BG99 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pknox2Q8BG99 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pknox2Q8BG99 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pknox2Q8BG99 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pknox2Q8BG99 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pknox2Q8BG99 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pknox2Q8BG99 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pknox2Q8BG99 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pknox2Q8BG99 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Pknox2Q8BG99 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Pknox2Q8BG99 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pknox2Q8BG99 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pknox2Q8BG99 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pknox2Q8BG99 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pknox2Q8BG99 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pknox2Q8BG99 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pknox2Q8BG99 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pknox2Q8BG99 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pknox2Q8BG99 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pknox2Q8BG99 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pknox2Q8BG99 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pknox2Q8BG99 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Pknox2Q8BG99 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pknox2Q8BG99 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pknox2Q8BG99 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pknox2Q8BG99 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pknox2Q8BG99 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pknox2Q8BG99 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pknox2Q8BG99 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pknox2Q8BG99 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pknox2Q8BG99 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pknox2Q8BG99 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pknox2Q8BG99 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pknox2Q8BG99 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pknox2Q8BG99 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pknox2Q8BG99 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pknox2Q8BG99 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Pknox2Q8BG99 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pknox2Q8BG99 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pknox2Q8BG99 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pknox2Q8BG99 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pknox2Q8BG99 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pknox2Q8BG99 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pknox2Q8BG99 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pknox2Q8BG99 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pknox2Q8BG99 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pknox2Q8BG99 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 196.2 ms