Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NfascQ810U3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NfascQ810U3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NfascQ810U3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NfascQ810U3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NfascQ810U3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NfascQ810U3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NfascQ810U3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NfascQ810U3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NfascQ810U3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NfascQ810U3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NfascQ810U3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NfascQ810U3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NfascQ810U3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NfascQ810U3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NfascQ810U3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NfascQ810U3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NfascQ810U3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NfascQ810U3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NfascQ810U3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NfascQ810U3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NfascQ810U3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NfascQ810U3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NfascQ810U3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NfascQ810U3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NfascQ810U3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NfascQ810U3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NfascQ810U3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NfascQ810U3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NfascQ810U3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NfascQ810U3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NfascQ810U3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NfascQ810U3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NfascQ810U3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NfascQ810U3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NfascQ810U3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NfascQ810U3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NfascQ810U3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NfascQ810U3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NfascQ810U3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NfascQ810U3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NfascQ810U3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NfascQ810U3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NfascQ810U3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NfascQ810U3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NfascQ810U3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NfascQ810U3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NfascQ810U3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NfascQ810U3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NfascQ810U3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NfascQ810U3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NfascQ810U3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NfascQ810U3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NfascQ810U3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NfascQ810U3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NfascQ810U3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NfascQ810U3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NfascQ810U3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NfascQ810U3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NfascQ810U3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NfascQ810U3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NfascQ810U3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NfascQ810U3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NfascQ810U3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NfascQ810U3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NfascQ810U3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NfascQ810U3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
NfascQ810U3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NfascQ810U3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NfascQ810U3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NfascQ810U3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NfascQ810U3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NfascQ810U3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NfascQ810U3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NfascQ810U3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NfascQ810U3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NfascQ810U3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NfascQ810U3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NfascQ810U3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NfascQ810U3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NfascQ810U3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NfascQ810U3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NfascQ810U3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NfascQ810U3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NfascQ810U3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NfascQ810U3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NfascQ810U3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NfascQ810U3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NfascQ810U3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NfascQ810U3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NfascQ810U3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NfascQ810U3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NfascQ810U3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NfascQ810U3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NfascQ810U3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NfascQ810U3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NfascQ810U3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NfascQ810U3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NfascQ810U3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NfascQ810U3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms