Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cracr2bQ80ZJ8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cracr2bQ80ZJ8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cracr2bQ80ZJ8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cracr2bQ80ZJ8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cracr2bQ80ZJ8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cracr2bQ80ZJ8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cracr2bQ80ZJ8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cracr2bQ80ZJ8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cracr2bQ80ZJ8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cracr2bQ80ZJ8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cracr2bQ80ZJ8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cracr2bQ80ZJ8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cracr2bQ80ZJ8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cracr2bQ80ZJ8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cracr2bQ80ZJ8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cracr2bQ80ZJ8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cracr2bQ80ZJ8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cracr2bQ80ZJ8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cracr2bQ80ZJ8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cracr2bQ80ZJ8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cracr2bQ80ZJ8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cracr2bQ80ZJ8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cracr2bQ80ZJ8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cracr2bQ80ZJ8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cracr2bQ80ZJ8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cracr2bQ80ZJ8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cracr2bQ80ZJ8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cracr2bQ80ZJ8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cracr2bQ80ZJ8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cracr2bQ80ZJ8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cracr2bQ80ZJ8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cracr2bQ80ZJ8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cracr2bQ80ZJ8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cracr2bQ80ZJ8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cracr2bQ80ZJ8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cracr2bQ80ZJ8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cracr2bQ80ZJ8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cracr2bQ80ZJ8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cracr2bQ80ZJ8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cracr2bQ80ZJ8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cracr2bQ80ZJ8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cracr2bQ80ZJ8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cracr2bQ80ZJ8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cracr2bQ80ZJ8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cracr2bQ80ZJ8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cracr2bQ80ZJ8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cracr2bQ80ZJ8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cracr2bQ80ZJ8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cracr2bQ80ZJ8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cracr2bQ80ZJ8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cracr2bQ80ZJ8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cracr2bQ80ZJ8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cracr2bQ80ZJ8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cracr2bQ80ZJ8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cracr2bQ80ZJ8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cracr2bQ80ZJ8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cracr2bQ80ZJ8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cracr2bQ80ZJ8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cracr2bQ80ZJ8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cracr2bQ80ZJ8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cracr2bQ80ZJ8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cracr2bQ80ZJ8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cracr2bQ80ZJ8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cracr2bQ80ZJ8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cracr2bQ80ZJ8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Cracr2bQ80ZJ8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Cracr2bQ80ZJ8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cracr2bQ80ZJ8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cracr2bQ80ZJ8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cracr2bQ80ZJ8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cracr2bQ80ZJ8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cracr2bQ80ZJ8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cracr2bQ80ZJ8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cracr2bQ80ZJ8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cracr2bQ80ZJ8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cracr2bQ80ZJ8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cracr2bQ80ZJ8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cracr2bQ80ZJ8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cracr2bQ80ZJ8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cracr2bQ80ZJ8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cracr2bQ80ZJ8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cracr2bQ80ZJ8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cracr2bQ80ZJ8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cracr2bQ80ZJ8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cracr2bQ80ZJ8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cracr2bQ80ZJ8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cracr2bQ80ZJ8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cracr2bQ80ZJ8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cracr2bQ80ZJ8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cracr2bQ80ZJ8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cracr2bQ80ZJ8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms