Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS9

Stkld1, Serine/threonine kinase-like domain-containing protein STKLD1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stkld1Q80YS9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stkld1Q80YS9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stkld1Q80YS9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stkld1Q80YS9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Stkld1Q80YS9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stkld1Q80YS9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stkld1Q80YS9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stkld1Q80YS9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stkld1Q80YS9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stkld1Q80YS9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stkld1Q80YS9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stkld1Q80YS9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stkld1Q80YS9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stkld1Q80YS9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stkld1Q80YS9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stkld1Q80YS9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stkld1Q80YS9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Stkld1Q80YS9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stkld1Q80YS9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stkld1Q80YS9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stkld1Q80YS9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stkld1Q80YS9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stkld1Q80YS9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stkld1Q80YS9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stkld1Q80YS9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stkld1Q80YS9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stkld1Q80YS9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stkld1Q80YS9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stkld1Q80YS9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stkld1Q80YS9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stkld1Q80YS9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stkld1Q80YS9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stkld1Q80YS9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stkld1Q80YS9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stkld1Q80YS9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Stkld1Q80YS9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Stkld1Q80YS9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stkld1Q80YS9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stkld1Q80YS9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stkld1Q80YS9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stkld1Q80YS9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stkld1Q80YS9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stkld1Q80YS9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stkld1Q80YS9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stkld1Q80YS9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stkld1Q80YS9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stkld1Q80YS9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stkld1Q80YS9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stkld1Q80YS9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stkld1Q80YS9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Stkld1Q80YS9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Stkld1Q80YS9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stkld1Q80YS9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stkld1Q80YS9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Stkld1Q80YS9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Stkld1Q80YS9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Stkld1Q80YS9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stkld1Q80YS9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stkld1Q80YS9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stkld1Q80YS9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stkld1Q80YS9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stkld1Q80YS9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stkld1Q80YS9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stkld1Q80YS9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stkld1Q80YS9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stkld1Q80YS9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stkld1Q80YS9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stkld1Q80YS9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stkld1Q80YS9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Stkld1Q80YS9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stkld1Q80YS9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stkld1Q80YS9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stkld1Q80YS9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stkld1Q80YS9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Stkld1Q80YS9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stkld1Q80YS9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stkld1Q80YS9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stkld1Q80YS9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stkld1Q80YS9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stkld1Q80YS9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stkld1Q80YS9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Stkld1Q80YS9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stkld1Q80YS9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stkld1Q80YS9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stkld1Q80YS9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stkld1Q80YS9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stkld1Q80YS9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stkld1Q80YS9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stkld1Q80YS9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stkld1Q80YS9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stkld1Q80YS9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stkld1Q80YS9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stkld1Q80YS9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stkld1Q80YS9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stkld1Q80YS9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stkld1Q80YS9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stkld1Q80YS9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stkld1Q80YS9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stkld1Q80YS9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stkld1Q80YS9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 168.9 ms