Protein–RNA interactions for Protein: Q80WC3

Tnrc18, Trinucleotide repeat-containing gene 18 protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,878 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc18Q80WC3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
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Tnrc18Q80WC3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnrc18Q80WC3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnrc18Q80WC3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnrc18Q80WC3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnrc18Q80WC3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnrc18Q80WC3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnrc18Q80WC3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnrc18Q80WC3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnrc18Q80WC3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnrc18Q80WC3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnrc18Q80WC3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnrc18Q80WC3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnrc18Q80WC3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnrc18Q80WC3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnrc18Q80WC3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnrc18Q80WC3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnrc18Q80WC3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnrc18Q80WC3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnrc18Q80WC3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnrc18Q80WC3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnrc18Q80WC3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnrc18Q80WC3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnrc18Q80WC3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnrc18Q80WC3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnrc18Q80WC3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
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Tnrc18Q80WC3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tnrc18Q80WC3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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Tnrc18Q80WC3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnrc18Q80WC3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnrc18Q80WC3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnrc18Q80WC3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnrc18Q80WC3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnrc18Q80WC3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnrc18Q80WC3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnrc18Q80WC3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnrc18Q80WC3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnrc18Q80WC3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnrc18Q80WC3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnrc18Q80WC3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnrc18Q80WC3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnrc18Q80WC3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnrc18Q80WC3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnrc18Q80WC3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnrc18Q80WC3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnrc18Q80WC3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
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Tnrc18Q80WC3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnrc18Q80WC3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnrc18Q80WC3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Tnrc18Q80WC3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnrc18Q80WC3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnrc18Q80WC3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Tnrc18Q80WC3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnrc18Q80WC3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnrc18Q80WC3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnrc18Q80WC3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnrc18Q80WC3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Tnrc18Q80WC3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Tnrc18Q80WC3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnrc18Q80WC3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnrc18Q80WC3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnrc18Q80WC3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnrc18Q80WC3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnrc18Q80WC3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnrc18Q80WC3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnrc18Q80WC3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnrc18Q80WC3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnrc18Q80WC3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnrc18Q80WC3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnrc18Q80WC3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnrc18Q80WC3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnrc18Q80WC3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnrc18Q80WC3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnrc18Q80WC3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnrc18Q80WC3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnrc18Q80WC3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnrc18Q80WC3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tnrc18Q80WC3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tnrc18Q80WC3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tnrc18Q80WC3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tnrc18Q80WC3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnrc18Q80WC3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnrc18Q80WC3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnrc18Q80WC3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnrc18Q80WC3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnrc18Q80WC3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnrc18Q80WC3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnrc18Q80WC3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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