Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ell3Q80VR2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ell3Q80VR2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ell3Q80VR2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ell3Q80VR2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ell3Q80VR2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ell3Q80VR2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ell3Q80VR2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ell3Q80VR2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ell3Q80VR2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ell3Q80VR2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ell3Q80VR2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ell3Q80VR2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ell3Q80VR2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ell3Q80VR2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ell3Q80VR2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ell3Q80VR2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ell3Q80VR2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ell3Q80VR2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ell3Q80VR2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ell3Q80VR2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ell3Q80VR2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ell3Q80VR2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ell3Q80VR2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ell3Q80VR2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ell3Q80VR2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ell3Q80VR2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ell3Q80VR2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ell3Q80VR2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ell3Q80VR2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ell3Q80VR2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ell3Q80VR2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ell3Q80VR2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ell3Q80VR2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ell3Q80VR2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ell3Q80VR2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ell3Q80VR2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ell3Q80VR2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ell3Q80VR2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ell3Q80VR2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ell3Q80VR2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ell3Q80VR2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ell3Q80VR2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ell3Q80VR2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ell3Q80VR2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ell3Q80VR2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ell3Q80VR2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ell3Q80VR2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ell3Q80VR2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ell3Q80VR2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ell3Q80VR2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ell3Q80VR2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ell3Q80VR2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ell3Q80VR2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ell3Q80VR2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ell3Q80VR2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ell3Q80VR2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ell3Q80VR2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ell3Q80VR2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ell3Q80VR2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ell3Q80VR2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ell3Q80VR2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ell3Q80VR2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ell3Q80VR2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ell3Q80VR2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ell3Q80VR2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ell3Q80VR2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ell3Q80VR2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ell3Q80VR2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ell3Q80VR2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ell3Q80VR2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ell3Q80VR2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ell3Q80VR2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ell3Q80VR2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ell3Q80VR2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ell3Q80VR2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ell3Q80VR2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ell3Q80VR2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ell3Q80VR2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ell3Q80VR2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ell3Q80VR2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ell3Q80VR2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ell3Q80VR2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ell3Q80VR2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ell3Q80VR2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ell3Q80VR2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ell3Q80VR2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ell3Q80VR2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ell3Q80VR2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ell3Q80VR2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ell3Q80VR2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ell3Q80VR2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ell3Q80VR2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ell3Q80VR2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ell3Q80VR2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ell3Q80VR2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ell3Q80VR2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ell3Q80VR2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ell3Q80VR2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ell3Q80VR2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms