Protein–RNA interactions for Protein: Q80VN0

Cfap100, Cilia- and flagella-associated protein 100, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap100Q80VN0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cfap100Q80VN0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cfap100Q80VN0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cfap100Q80VN0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cfap100Q80VN0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cfap100Q80VN0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cfap100Q80VN0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cfap100Q80VN0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cfap100Q80VN0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cfap100Q80VN0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cfap100Q80VN0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cfap100Q80VN0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cfap100Q80VN0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cfap100Q80VN0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cfap100Q80VN0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cfap100Q80VN0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cfap100Q80VN0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfap100Q80VN0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfap100Q80VN0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfap100Q80VN0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfap100Q80VN0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfap100Q80VN0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfap100Q80VN0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cfap100Q80VN0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cfap100Q80VN0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfap100Q80VN0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfap100Q80VN0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfap100Q80VN0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfap100Q80VN0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfap100Q80VN0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfap100Q80VN0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfap100Q80VN0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfap100Q80VN0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cfap100Q80VN0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cfap100Q80VN0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cfap100Q80VN0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cfap100Q80VN0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cfap100Q80VN0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cfap100Q80VN0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cfap100Q80VN0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cfap100Q80VN0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cfap100Q80VN0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cfap100Q80VN0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cfap100Q80VN0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cfap100Q80VN0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cfap100Q80VN0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cfap100Q80VN0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfap100Q80VN0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfap100Q80VN0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfap100Q80VN0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfap100Q80VN0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfap100Q80VN0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cfap100Q80VN0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cfap100Q80VN0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cfap100Q80VN0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cfap100Q80VN0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cfap100Q80VN0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cfap100Q80VN0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cfap100Q80VN0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cfap100Q80VN0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cfap100Q80VN0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cfap100Q80VN0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cfap100Q80VN0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cfap100Q80VN0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cfap100Q80VN0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cfap100Q80VN0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfap100Q80VN0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfap100Q80VN0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfap100Q80VN0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfap100Q80VN0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfap100Q80VN0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfap100Q80VN0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfap100Q80VN0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cfap100Q80VN0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cfap100Q80VN0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cfap100Q80VN0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cfap100Q80VN0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cfap100Q80VN0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cfap100Q80VN0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cfap100Q80VN0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cfap100Q80VN0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cfap100Q80VN0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cfap100Q80VN0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cfap100Q80VN0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cfap100Q80VN0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cfap100Q80VN0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cfap100Q80VN0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cfap100Q80VN0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cfap100Q80VN0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cfap100Q80VN0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cfap100Q80VN0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cfap100Q80VN0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cfap100Q80VN0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cfap100Q80VN0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cfap100Q80VN0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cfap100Q80VN0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cfap100Q80VN0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cfap100Q80VN0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cfap100Q80VN0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cfap100Q80VN0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms