Protein–RNA interactions for Protein: Q80US4

Actr5, Actin-related protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr5Q80US4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Actr5Q80US4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Actr5Q80US4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Actr5Q80US4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Actr5Q80US4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Actr5Q80US4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Actr5Q80US4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Actr5Q80US4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Actr5Q80US4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Actr5Q80US4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Actr5Q80US4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Actr5Q80US4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Actr5Q80US4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Actr5Q80US4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Actr5Q80US4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Actr5Q80US4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Actr5Q80US4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Actr5Q80US4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Actr5Q80US4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Actr5Q80US4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Actr5Q80US4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Actr5Q80US4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Actr5Q80US4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Actr5Q80US4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Actr5Q80US4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Actr5Q80US4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Actr5Q80US4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Actr5Q80US4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Actr5Q80US4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Actr5Q80US4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Actr5Q80US4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Actr5Q80US4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Actr5Q80US4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Actr5Q80US4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Actr5Q80US4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Actr5Q80US4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Actr5Q80US4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Actr5Q80US4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Actr5Q80US4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Actr5Q80US4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Actr5Q80US4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Actr5Q80US4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Actr5Q80US4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Actr5Q80US4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Actr5Q80US4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Actr5Q80US4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Actr5Q80US4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Actr5Q80US4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Actr5Q80US4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Actr5Q80US4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Actr5Q80US4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Actr5Q80US4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Actr5Q80US4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Actr5Q80US4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Actr5Q80US4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Actr5Q80US4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Actr5Q80US4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Actr5Q80US4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Actr5Q80US4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Actr5Q80US4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Actr5Q80US4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Actr5Q80US4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Actr5Q80US4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Actr5Q80US4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Actr5Q80US4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Actr5Q80US4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Actr5Q80US4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Actr5Q80US4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Actr5Q80US4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Actr5Q80US4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Actr5Q80US4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Actr5Q80US4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Actr5Q80US4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Actr5Q80US4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Actr5Q80US4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Actr5Q80US4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Actr5Q80US4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Actr5Q80US4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Actr5Q80US4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Actr5Q80US4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Actr5Q80US4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Actr5Q80US4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Actr5Q80US4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Actr5Q80US4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Actr5Q80US4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Actr5Q80US4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Actr5Q80US4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Actr5Q80US4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Actr5Q80US4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Actr5Q80US4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Actr5Q80US4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Actr5Q80US4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Actr5Q80US4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Actr5Q80US4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Actr5Q80US4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Actr5Q80US4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Actr5Q80US4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Actr5Q80US4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Actr5Q80US4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Actr5Q80US4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms