Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sestd1Q80UK0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sestd1Q80UK0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sestd1Q80UK0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sestd1Q80UK0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sestd1Q80UK0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sestd1Q80UK0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sestd1Q80UK0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sestd1Q80UK0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sestd1Q80UK0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sestd1Q80UK0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sestd1Q80UK0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sestd1Q80UK0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sestd1Q80UK0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sestd1Q80UK0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sestd1Q80UK0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sestd1Q80UK0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sestd1Q80UK0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sestd1Q80UK0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sestd1Q80UK0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sestd1Q80UK0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sestd1Q80UK0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Sestd1Q80UK0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sestd1Q80UK0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sestd1Q80UK0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sestd1Q80UK0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sestd1Q80UK0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sestd1Q80UK0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Sestd1Q80UK0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sestd1Q80UK0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sestd1Q80UK0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sestd1Q80UK0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sestd1Q80UK0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sestd1Q80UK0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sestd1Q80UK0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Sestd1Q80UK0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Sestd1Q80UK0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sestd1Q80UK0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sestd1Q80UK0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sestd1Q80UK0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sestd1Q80UK0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sestd1Q80UK0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sestd1Q80UK0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sestd1Q80UK0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sestd1Q80UK0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sestd1Q80UK0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sestd1Q80UK0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Sestd1Q80UK0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sestd1Q80UK0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sestd1Q80UK0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sestd1Q80UK0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sestd1Q80UK0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sestd1Q80UK0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sestd1Q80UK0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Sestd1Q80UK0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sestd1Q80UK0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sestd1Q80UK0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sestd1Q80UK0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sestd1Q80UK0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sestd1Q80UK0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sestd1Q80UK0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sestd1Q80UK0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sestd1Q80UK0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sestd1Q80UK0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sestd1Q80UK0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sestd1Q80UK0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sestd1Q80UK0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sestd1Q80UK0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sestd1Q80UK0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sestd1Q80UK0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sestd1Q80UK0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sestd1Q80UK0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sestd1Q80UK0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sestd1Q80UK0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Sestd1Q80UK0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Sestd1Q80UK0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sestd1Q80UK0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sestd1Q80UK0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sestd1Q80UK0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sestd1Q80UK0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sestd1Q80UK0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sestd1Q80UK0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sestd1Q80UK0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sestd1Q80UK0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sestd1Q80UK0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sestd1Q80UK0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sestd1Q80UK0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sestd1Q80UK0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sestd1Q80UK0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sestd1Q80UK0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sestd1Q80UK0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sestd1Q80UK0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sestd1Q80UK0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sestd1Q80UK0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sestd1Q80UK0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sestd1Q80UK0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sestd1Q80UK0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sestd1Q80UK0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sestd1Q80UK0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sestd1Q80UK0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms