Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pja2Q80U04 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pja2Q80U04 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pja2Q80U04 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pja2Q80U04 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pja2Q80U04 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pja2Q80U04 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pja2Q80U04 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pja2Q80U04 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pja2Q80U04 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pja2Q80U04 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pja2Q80U04 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pja2Q80U04 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pja2Q80U04 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pja2Q80U04 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pja2Q80U04 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pja2Q80U04 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pja2Q80U04 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pja2Q80U04 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pja2Q80U04 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pja2Q80U04 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pja2Q80U04 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pja2Q80U04 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pja2Q80U04 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pja2Q80U04 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pja2Q80U04 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pja2Q80U04 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pja2Q80U04 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pja2Q80U04 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pja2Q80U04 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pja2Q80U04 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pja2Q80U04 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pja2Q80U04 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pja2Q80U04 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pja2Q80U04 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pja2Q80U04 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pja2Q80U04 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pja2Q80U04 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pja2Q80U04 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pja2Q80U04 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pja2Q80U04 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pja2Q80U04 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pja2Q80U04 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pja2Q80U04 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pja2Q80U04 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pja2Q80U04 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pja2Q80U04 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pja2Q80U04 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pja2Q80U04 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pja2Q80U04 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pja2Q80U04 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pja2Q80U04 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pja2Q80U04 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pja2Q80U04 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Pja2Q80U04 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pja2Q80U04 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pja2Q80U04 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pja2Q80U04 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pja2Q80U04 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pja2Q80U04 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pja2Q80U04 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pja2Q80U04 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pja2Q80U04 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pja2Q80U04 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pja2Q80U04 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pja2Q80U04 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pja2Q80U04 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pja2Q80U04 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pja2Q80U04 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pja2Q80U04 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pja2Q80U04 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pja2Q80U04 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pja2Q80U04 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pja2Q80U04 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pja2Q80U04 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pja2Q80U04 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pja2Q80U04 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pja2Q80U04 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pja2Q80U04 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pja2Q80U04 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pja2Q80U04 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pja2Q80U04 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pja2Q80U04 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pja2Q80U04 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pja2Q80U04 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pja2Q80U04 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pja2Q80U04 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pja2Q80U04 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pja2Q80U04 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pja2Q80U04 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pja2Q80U04 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pja2Q80U04 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pja2Q80U04 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pja2Q80U04 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pja2Q80U04 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pja2Q80U04 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pja2Q80U04 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pja2Q80U04 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pja2Q80U04 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pja2Q80U04 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms