Protein–RNA interactions for Protein: Q80TQ2

Cyld, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, mousemouse

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Length 952 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CyldQ80TQ2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CyldQ80TQ2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CyldQ80TQ2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CyldQ80TQ2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CyldQ80TQ2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CyldQ80TQ2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CyldQ80TQ2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CyldQ80TQ2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CyldQ80TQ2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CyldQ80TQ2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CyldQ80TQ2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CyldQ80TQ2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CyldQ80TQ2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CyldQ80TQ2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CyldQ80TQ2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CyldQ80TQ2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CyldQ80TQ2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CyldQ80TQ2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CyldQ80TQ2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CyldQ80TQ2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CyldQ80TQ2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CyldQ80TQ2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CyldQ80TQ2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CyldQ80TQ2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CyldQ80TQ2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CyldQ80TQ2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CyldQ80TQ2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CyldQ80TQ2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CyldQ80TQ2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CyldQ80TQ2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CyldQ80TQ2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CyldQ80TQ2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CyldQ80TQ2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CyldQ80TQ2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CyldQ80TQ2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CyldQ80TQ2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CyldQ80TQ2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CyldQ80TQ2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CyldQ80TQ2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CyldQ80TQ2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CyldQ80TQ2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CyldQ80TQ2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CyldQ80TQ2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CyldQ80TQ2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CyldQ80TQ2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CyldQ80TQ2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CyldQ80TQ2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CyldQ80TQ2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CyldQ80TQ2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CyldQ80TQ2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CyldQ80TQ2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CyldQ80TQ2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CyldQ80TQ2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CyldQ80TQ2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CyldQ80TQ2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CyldQ80TQ2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CyldQ80TQ2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CyldQ80TQ2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CyldQ80TQ2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CyldQ80TQ2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CyldQ80TQ2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CyldQ80TQ2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CyldQ80TQ2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CyldQ80TQ2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CyldQ80TQ2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CyldQ80TQ2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CyldQ80TQ2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CyldQ80TQ2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CyldQ80TQ2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CyldQ80TQ2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CyldQ80TQ2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CyldQ80TQ2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CyldQ80TQ2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CyldQ80TQ2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CyldQ80TQ2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CyldQ80TQ2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CyldQ80TQ2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CyldQ80TQ2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CyldQ80TQ2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CyldQ80TQ2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CyldQ80TQ2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CyldQ80TQ2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CyldQ80TQ2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CyldQ80TQ2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CyldQ80TQ2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CyldQ80TQ2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CyldQ80TQ2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CyldQ80TQ2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CyldQ80TQ2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CyldQ80TQ2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CyldQ80TQ2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CyldQ80TQ2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CyldQ80TQ2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CyldQ80TQ2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CyldQ80TQ2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CyldQ80TQ2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CyldQ80TQ2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CyldQ80TQ2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CyldQ80TQ2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CyldQ80TQ2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.6 ms