Protein–RNA interactions for Protein: Q80TJ7

Phf8, Histone lysine demethylase PHF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf8Q80TJ7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Phf8Q80TJ7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Phf8Q80TJ7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Phf8Q80TJ7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Phf8Q80TJ7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Phf8Q80TJ7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Phf8Q80TJ7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Phf8Q80TJ7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Phf8Q80TJ7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Phf8Q80TJ7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Phf8Q80TJ7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Phf8Q80TJ7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Phf8Q80TJ7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Phf8Q80TJ7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Phf8Q80TJ7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Phf8Q80TJ7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Phf8Q80TJ7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phf8Q80TJ7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Phf8Q80TJ7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phf8Q80TJ7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phf8Q80TJ7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phf8Q80TJ7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phf8Q80TJ7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phf8Q80TJ7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phf8Q80TJ7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phf8Q80TJ7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phf8Q80TJ7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phf8Q80TJ7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Phf8Q80TJ7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Phf8Q80TJ7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Phf8Q80TJ7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Phf8Q80TJ7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Phf8Q80TJ7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Phf8Q80TJ7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Phf8Q80TJ7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Phf8Q80TJ7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Phf8Q80TJ7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Phf8Q80TJ7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Phf8Q80TJ7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Phf8Q80TJ7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Phf8Q80TJ7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Phf8Q80TJ7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Phf8Q80TJ7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Phf8Q80TJ7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Phf8Q80TJ7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Phf8Q80TJ7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phf8Q80TJ7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phf8Q80TJ7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phf8Q80TJ7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phf8Q80TJ7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phf8Q80TJ7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phf8Q80TJ7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phf8Q80TJ7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phf8Q80TJ7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phf8Q80TJ7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phf8Q80TJ7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phf8Q80TJ7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phf8Q80TJ7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phf8Q80TJ7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phf8Q80TJ7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phf8Q80TJ7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phf8Q80TJ7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phf8Q80TJ7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phf8Q80TJ7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phf8Q80TJ7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phf8Q80TJ7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phf8Q80TJ7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phf8Q80TJ7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Phf8Q80TJ7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Phf8Q80TJ7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Phf8Q80TJ7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phf8Q80TJ7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phf8Q80TJ7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phf8Q80TJ7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phf8Q80TJ7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phf8Q80TJ7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phf8Q80TJ7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phf8Q80TJ7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phf8Q80TJ7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phf8Q80TJ7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phf8Q80TJ7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phf8Q80TJ7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phf8Q80TJ7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phf8Q80TJ7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phf8Q80TJ7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phf8Q80TJ7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phf8Q80TJ7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phf8Q80TJ7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Phf8Q80TJ7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Phf8Q80TJ7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phf8Q80TJ7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phf8Q80TJ7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phf8Q80TJ7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phf8Q80TJ7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phf8Q80TJ7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phf8Q80TJ7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phf8Q80TJ7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phf8Q80TJ7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phf8Q80TJ7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Phf8Q80TJ7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms