Protein–RNA interactions for Protein: Q80ST9

Lca5, Lebercilin, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lca5Q80ST9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lca5Q80ST9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lca5Q80ST9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lca5Q80ST9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lca5Q80ST9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lca5Q80ST9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lca5Q80ST9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lca5Q80ST9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lca5Q80ST9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lca5Q80ST9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lca5Q80ST9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lca5Q80ST9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lca5Q80ST9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lca5Q80ST9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lca5Q80ST9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lca5Q80ST9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lca5Q80ST9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lca5Q80ST9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lca5Q80ST9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lca5Q80ST9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lca5Q80ST9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lca5Q80ST9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lca5Q80ST9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lca5Q80ST9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lca5Q80ST9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lca5Q80ST9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lca5Q80ST9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lca5Q80ST9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Lca5Q80ST9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lca5Q80ST9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lca5Q80ST9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lca5Q80ST9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lca5Q80ST9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lca5Q80ST9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lca5Q80ST9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lca5Q80ST9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lca5Q80ST9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lca5Q80ST9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lca5Q80ST9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lca5Q80ST9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lca5Q80ST9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lca5Q80ST9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lca5Q80ST9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lca5Q80ST9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lca5Q80ST9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Lca5Q80ST9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lca5Q80ST9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lca5Q80ST9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lca5Q80ST9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lca5Q80ST9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lca5Q80ST9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Lca5Q80ST9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lca5Q80ST9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lca5Q80ST9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Lca5Q80ST9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lca5Q80ST9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lca5Q80ST9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lca5Q80ST9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lca5Q80ST9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lca5Q80ST9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lca5Q80ST9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lca5Q80ST9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lca5Q80ST9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lca5Q80ST9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lca5Q80ST9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lca5Q80ST9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lca5Q80ST9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lca5Q80ST9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lca5Q80ST9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lca5Q80ST9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lca5Q80ST9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lca5Q80ST9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lca5Q80ST9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lca5Q80ST9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lca5Q80ST9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lca5Q80ST9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lca5Q80ST9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lca5Q80ST9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Lca5Q80ST9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lca5Q80ST9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lca5Q80ST9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lca5Q80ST9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lca5Q80ST9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lca5Q80ST9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lca5Q80ST9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lca5Q80ST9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lca5Q80ST9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lca5Q80ST9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lca5Q80ST9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lca5Q80ST9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lca5Q80ST9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lca5Q80ST9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lca5Q80ST9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lca5Q80ST9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lca5Q80ST9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Lca5Q80ST9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lca5Q80ST9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lca5Q80ST9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lca5Q80ST9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lca5Q80ST9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms