Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ClmQ7TSN2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ClmQ7TSN2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ClmQ7TSN2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ClmQ7TSN2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ClmQ7TSN2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ClmQ7TSN2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ClmQ7TSN2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ClmQ7TSN2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ClmQ7TSN2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ClmQ7TSN2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ClmQ7TSN2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ClmQ7TSN2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ClmQ7TSN2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ClmQ7TSN2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ClmQ7TSN2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ClmQ7TSN2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ClmQ7TSN2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ClmQ7TSN2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ClmQ7TSN2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ClmQ7TSN2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ClmQ7TSN2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ClmQ7TSN2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ClmQ7TSN2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ClmQ7TSN2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ClmQ7TSN2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ClmQ7TSN2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ClmQ7TSN2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ClmQ7TSN2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ClmQ7TSN2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ClmQ7TSN2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ClmQ7TSN2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ClmQ7TSN2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ClmQ7TSN2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ClmQ7TSN2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ClmQ7TSN2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ClmQ7TSN2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ClmQ7TSN2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ClmQ7TSN2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ClmQ7TSN2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ClmQ7TSN2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ClmQ7TSN2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ClmQ7TSN2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ClmQ7TSN2 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ClmQ7TSN2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ClmQ7TSN2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ClmQ7TSN2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ClmQ7TSN2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ClmQ7TSN2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ClmQ7TSN2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ClmQ7TSN2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ClmQ7TSN2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ClmQ7TSN2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ClmQ7TSN2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ClmQ7TSN2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ClmQ7TSN2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ClmQ7TSN2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ClmQ7TSN2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ClmQ7TSN2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ClmQ7TSN2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ClmQ7TSN2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ClmQ7TSN2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ClmQ7TSN2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ClmQ7TSN2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ClmQ7TSN2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ClmQ7TSN2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ClmQ7TSN2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ClmQ7TSN2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ClmQ7TSN2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ClmQ7TSN2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ClmQ7TSN2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ClmQ7TSN2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ClmQ7TSN2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ClmQ7TSN2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ClmQ7TSN2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ClmQ7TSN2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ClmQ7TSN2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ClmQ7TSN2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ClmQ7TSN2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ClmQ7TSN2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ClmQ7TSN2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ClmQ7TSN2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ClmQ7TSN2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ClmQ7TSN2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ClmQ7TSN2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ClmQ7TSN2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ClmQ7TSN2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ClmQ7TSN2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ClmQ7TSN2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ClmQ7TSN2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ClmQ7TSN2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ClmQ7TSN2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ClmQ7TSN2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ClmQ7TSN2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ClmQ7TSN2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ClmQ7TSN2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ClmQ7TSN2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ClmQ7TSN2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ClmQ7TSN2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ClmQ7TSN2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms