Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctdp1Q7TSG2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctdp1Q7TSG2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctdp1Q7TSG2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctdp1Q7TSG2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctdp1Q7TSG2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctdp1Q7TSG2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctdp1Q7TSG2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctdp1Q7TSG2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctdp1Q7TSG2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctdp1Q7TSG2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctdp1Q7TSG2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctdp1Q7TSG2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctdp1Q7TSG2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctdp1Q7TSG2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctdp1Q7TSG2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctdp1Q7TSG2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctdp1Q7TSG2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctdp1Q7TSG2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctdp1Q7TSG2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctdp1Q7TSG2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctdp1Q7TSG2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctdp1Q7TSG2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctdp1Q7TSG2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctdp1Q7TSG2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctdp1Q7TSG2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctdp1Q7TSG2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Ctdp1Q7TSG2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctdp1Q7TSG2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctdp1Q7TSG2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctdp1Q7TSG2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctdp1Q7TSG2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctdp1Q7TSG2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctdp1Q7TSG2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctdp1Q7TSG2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctdp1Q7TSG2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctdp1Q7TSG2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctdp1Q7TSG2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctdp1Q7TSG2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctdp1Q7TSG2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctdp1Q7TSG2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctdp1Q7TSG2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctdp1Q7TSG2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctdp1Q7TSG2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctdp1Q7TSG2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctdp1Q7TSG2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctdp1Q7TSG2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctdp1Q7TSG2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctdp1Q7TSG2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctdp1Q7TSG2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctdp1Q7TSG2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctdp1Q7TSG2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctdp1Q7TSG2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctdp1Q7TSG2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctdp1Q7TSG2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctdp1Q7TSG2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctdp1Q7TSG2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctdp1Q7TSG2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctdp1Q7TSG2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctdp1Q7TSG2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctdp1Q7TSG2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctdp1Q7TSG2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctdp1Q7TSG2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctdp1Q7TSG2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctdp1Q7TSG2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctdp1Q7TSG2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctdp1Q7TSG2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctdp1Q7TSG2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctdp1Q7TSG2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctdp1Q7TSG2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctdp1Q7TSG2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctdp1Q7TSG2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ctdp1Q7TSG2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ctdp1Q7TSG2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ctdp1Q7TSG2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctdp1Q7TSG2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctdp1Q7TSG2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctdp1Q7TSG2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctdp1Q7TSG2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctdp1Q7TSG2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctdp1Q7TSG2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctdp1Q7TSG2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctdp1Q7TSG2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctdp1Q7TSG2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctdp1Q7TSG2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctdp1Q7TSG2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctdp1Q7TSG2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctdp1Q7TSG2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctdp1Q7TSG2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctdp1Q7TSG2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctdp1Q7TSG2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctdp1Q7TSG2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctdp1Q7TSG2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctdp1Q7TSG2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctdp1Q7TSG2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctdp1Q7TSG2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctdp1Q7TSG2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctdp1Q7TSG2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctdp1Q7TSG2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctdp1Q7TSG2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms